Leiter:
Dr. Michael Schmid e-mail
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Prof. Dr. Anton Hartmann e-mail
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Stellvertreter:
Dr. Michael Rothballer e-mail
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Der wissenschaftliche Schwerpunkt der Gruppe "Molekulare Mikrobenökologie" liegt innerhalb des Helmholtz Programms "Erde und Umwelt" mit einem Fokus auf "Nachhaltige Bioproduktion". In diesem Themengebiet spielt der Beitrag von Pflanzen-assoziierten Mikroorganismen zur Wachstumsstimulation bei Pflanzen eine zentrale Rolle bei der Verbesserung nachhaltiger Konzepte in der Landwirtschaft. Außerdem findet sich der Hauptthemenkomplex des Helmholtz Zentrums München, "Gesundheit und Umwelt", in einem weiteren wesentlichen Forschungsgebiet der Arbeitsgruppe wieder, das die Interaktion von humanpathogenen und Toxin-produzierenden Bakterien mit landwirtschaftlichen Nutzpflanzen zum Thema hat, sowie Studien mit Probiotika und Darmmikrobiota. Mit neuen wissenschaftlichen Erkenntnissen zum bakteriellen Signalling soll ein Beitrag zum besseren Verständnis der Mikroben-Eukaryoten Interaktion geleistet werden. Dies ist von großer Bedeutung sowohl um den Pflanzenertrag unter Stressbedingungen zu steigern als auch um mögliche Risiken landwirtschaftlicher Praktiken zu reduzieren. Insbesondere wird das Kontaminationspotential von Nahrungspflanzen durch Pathogene sowie Toxin-produzierenden Bakterien untersucht. Die Arbeitsgruppe beschäftigt sich auch mit der unmittelbaren Interaktion von Bakterien und menschlicher Gesundheit mit dem Schwerpunkt auf bakteriellen Signalstoffen sowohl von pathogenen als auch von probiotischen Bakterien und deren Wechselwirkungen mit der komplexen mikrobiellen Gemeinschaft im Darm und dem Immunsystem. Diese Forschungsarbeiten werden in enger Kooperation mit Arbeitsgruppen aus dem Gesundheitsbereich durchgeführt.

Die Expertise der Arbeitsgruppe reicht von der klassischen Mikrobiologie über Molekulargenetik mit einem Fokus auf molekularer Mikrobenphylogenie, bis hin zu komplexen Analysen von Struktur und Funktion von mikrobiellen Gemeinschaften und hochauflösenden mikroskopischen Techniken. Die Gruppe betreibt ein voll eingerichtetes molekularbiologisches Labor und eine Phytokammer mit der Erlaubnis zum Arbeiten mit Wildtyp und genetische modifizierten Bakterien- und Pilzstämmen der Sicherheitsstufe 2.

Folgende Hauptthemen fassen unsere wissenschaftlichen Aktivitäten zusammen:

• Mechanismen der Stimulierung von Pflanzenwachstum unter Stressbedingungen durch wurzelassoziierte stresstolerante Mikroorganismen mehr
• Mikrobielles Signalling im Zusammenhang mit Pflanzenwachstumsstimulation und Biofilmbildung mehr
• Mikrobielle Gemeinschaften in "Plant Microbial Fuel Cells" mehr
• Humanpathogene Bakterien in Nutzpflanzen mehr PathOrganic Projekt 
• Immunmodulatorische Substanzen von Gram-positiven Probiotika mehr
• Einfluss des Darmmikrobioms bei der Entwicklung von Diabetes mehr
• Immunochemische Analytik und Biosensoren mehr