Ein integrativer systembiologischer Ansatz für die kombinierte phänotypische, metabolische und proteomische Charakterisierung von Diabetes Typ II in Mausmodellen
T.Gröger (HMGU), S.Neschen (IEG, HMGU), H.Sarioglu (PROT, HMGU), M.Eschner (HMGU), S.Ly-Verdu (HMGU), R.Zimmermann (UR/HMGU)
- Fig. 1: Diabetes Pilotprojekt
Im Rahmen des "Deutschen Zentrums für Diabetesforschung e.V. (DZD)" kooperieren das Institut für Experimentelle Genetik / German Mouse Clinic mit der Abteilung für Proteinanalytik und der Kooperationsgruppe "Komplexe Molekulare Systeme" (Abb. 1).
Primäres Ziel ist dabei die integrative phänotypische, proteomische und metabolomische Charakterisierung von Typ-2-Diabetes, mit dem Schwerpunkt der vergleichenden statistischen Datenanalyse verschiedener Mausmodelle. Die verschiedenen prä-diabetische und diabetische Zustände werden in den untersuchten Mausmodellen anhand der Ernährung ausgelöst.
Umfassendes Stoffwechsel-und Proteom-Profiling wird an derselben Gewebeprobe durchgeführt und die Daten der Phänotypen und omic-Ebenen integrativ kombiniert (Abb. 2). Das ultimative Ziel des Projekts ist das Auffinden früher Biomarker. Dafür fokussiert sich die Kooperationsgruppe auf das Metabolic Fingerprinting und wendet verschiedene chromatographische und massenspektrometrische Methoden an, um Unterschiede im metabolischen Profil aufzudecken.
- Fig.2 Systembiologischer Ebenen-Ansatz. (* IGT: Ungepaarte Glukosetoleranz; IR: Insulinresistenz)
