Seminar
Mathematische Modellierung der Proteintransduktion: eine interaktive Einführung
Dozent:
Prof. Dr. Fabian Theis
M12 – Fakultät für Mathematik
Raum: 02.08.039
Tel.: +49 89 289-17961
Email: theis@ma.tum.de
Betreuung:
Dr. Christiane Fuchs
Tel.: +49 89 3187-3385
Email: christiane.fuchs@helmholtz-muenchen.de
Beschreibung
Proteintransduktion ist ein wesentlicher Bestandteil der Zellkommunikation und steuert wichtige Abläufe in lebenden Organismen. Ihre komplexe Dynamik lässt sich mit Hilfe mathematischer Modelle begreifen. Dieser fünftägige Blockkurs bietet eine Einführung in die mathematische Modellierung der Proteintransduktion. Vormittags werden den Studierenden in Form von Vorlesungen die Grundlagen der Systembiologie und verwendeten Molekularbiologie auf sehr einfachem Niveau, Differentialgleichungsmodelle, Modellschätzung, Modellwahl, statistischen Prognose und Programmierung in Matlab vermittelt. Nachmittags werden in Gruppenarbeit Übungs- und Programmieraufgaben bearbeitet. Im Laufe des Blockkurses werden die Studierenden eigenständig einen Datensatz zur Proteintransduktion analysieren und ihre Ergebnisse im Anschluss dokumentieren und präsentieren. Eine mögliche wissenschaftlich relevante Weiterführung der Arbeit ist möglich.
Verwendbarkeit: Masterstudiengänge Mathematik, Bioinformatik
Voraussetzungen: Grundkenntnisse in Statistik, Stochastik, gewöhnlichen Differentialgleichungen, Matlab oder R
ECTS: 4 (Vergabe nach Mitarbeit und Abschlussdokumentation)
Sprache: deutsch
Termin und Ort
Der Kurs findet statt vom 19. bis 23. März 2012, jeweils von 9:30 Uhr bis ca. 16 Uhr (inkl. Mittagspause).
Er wird abgehalten auf dem Gelände des Helmholtz Zentrums München, Ingolstädter Landstr. 1, 85764 Neuherberg. Eine Anfahrtsbeschreibung finden Sie hier.
Die Vorlesungen am Vormittag finden statt in Gebäude 56, Raum 163 (kleiner Seminarraum), die Übungen am Nachmittag in Gebäude 41a, Raum 001 (PC Schulungsraum). Einen Geländeplan finden Sie hier.
Kursmaterialien
Vorlesungsfolien:
Übungsblätter:
Datensätze:
- DataER
- DATA1_hall und DATA1_hall_inp (leicht modifiziert von dieser Seite)
- DataER2
- DataER3 und CovMat
