Computational Cell Maps

2020
Behzadi, S. ; Müller, N.S. ; Plant, C. ; Böhm, C.
Int. J. Data Sci. Anal. 10, 233–248 (2020)
Dwyer, D.B. ; Kalman, J.L. ; Budde, M. ; Kambeitz, J. ; Ruef, A. ; Antonucci, L.A. ; Kambeitz-Ilankovic, L. ; Hasan, A. ; Kondofersky, I. ; Anderson-Schmidt, H. ; Gade, K. ; Reich-Erkelenz, D. ; Adorjan, K. ; Senner, F. ; Schaupp, S. ; Andlauer, T.F.M. ; Comes, A.L. ; Schulte, E.C. ; Klöhn-Saghatolislam, F. ; Gryaznova, A. ; Hake, M. ; Bartholdi, K. ; Flatau-Nagel, L. ; Reitt, M. ; Quast, S. ; Stegmaier, S. ; Meyers, M. ; Emons, B. ; Haußleiter, I.S. ; Juckel, G. ; Nieratschker, V. ; Dannlowski, U. ; Yoshida, T. ; Schmauß, M. ; Zimmermann, J. ; Reimer, J. ; Wiltfang, J. ; Reininghaus, E. ; Anghelescu, I.G. ; Arolt, V. ; Baune, B.T. ; Konrad, C. ; Thiel, A. ; Fallgatter, A.J. ; Figge, C. ; von Hagen, M. ; Koller, M. ; Lang, F.U. ; Wigand, M.E. ; Becker, T. ; Jäger, M. ; Dietrich, D.E. ; Scherk, H. ; Spitzer, C. ; Folkerts, H. ; Witt, S.H. ; Degenhardt, F. ; Forstner, A.J. ; Rietschel, M. ; Nöthen, M.M. ; Müller, N.S. ; Papiol, S. ; Heilbronner, U. ; Falkai, P. ; Schulze, T.G. ; Koutsouleris, N.
JAMA psychiatry 77, 523-533 (2020)
Arloth, J. ; Eraslan, G. ; Andlauer, T.F.M. ; Martins, J. ; Iurato, S. ; Kühnel, B. ; Waldenberger, M. ; Frank, J. ; Gold, R. ; Hemmer, B. ; Luessi, F. ; Nischwitz, S. ; Paul, F. ; Wiendl, H. ; Gieger, C. ; Heilmann-Heimbach, S. ; Kacprowski, T. ; Laudes, M. ; Meitinger, T. ; Peters, A. ; Rawal, R. ; Strauch, K. ; Lucae, S. ; Müller-Myhsok, B. ; Rietschel, M. ; Theis, F.J. ; Binder, E.B. ; Müller, N.S.
PLoS Comput. Biol. 16:e1007616 (2020)
Guala, D. ; Ogris, C. ; Müller, N.S. ; Sonnhammer, E.L.L.
Brief. Bioinform. 21, 1224-1237 (2020)
Pitea, A. ; Kondofersky, I. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Unger, K.
Brief. Bioinform. 21, 272-281 (2020)
2019
Lauffer, F. ; Jargosch, M. ; Baghin, V. ; Krause, L. ; Kempf, W. ; Absmaier-Kijak, M. ; Morelli, M. ; Madonna, S. ; Marsais, F. ; Lepescheux, L. ; Albanesi, C. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Biedermann, T. ; Vandeghinste, N. ; Steidl, S. ; Eyerich, K.
J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol., accepted (2019)
Arloth, J. ; Eraslan, G. ; Andlauer, T. ; Gieger, C. ; Gold, R. ; Heilmann-Heimbach, S. ; Kacprowski, T. ; Meitinger, T. ; Laudes, M. ; Luessi, F. ; Müller-Myhsok, B. ; Nischwitz, S. ; Peters, A. ; Paul, F. ; Rawal, R. ; Strauch, K. ; Wiendl, H. ; Hemmer, B. ; Theis, F.J. ; Binder, E. ; Müller, N.S.
Mult. Scler. J. 25, 906-907 (2019)
Czamara, D. ; Eraslan, G. ; Lahti, J. ; Figueiredo, A.S. ; Girchenko, P. ; Lahti-Pulkkinen, M. ; Hämäläinen, E. ; Kajantie, E. ; Laivuori, H. ; Villa, P. ; Reynolds, R. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Räikkönen, K. ; Binder, E.
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, 1037-1037 (2019)
Schaupp, S. ; Budde, M. ; Kondofersky, I. ; Papiol, S. ; Heilbronner, U. ; Gade, K. ; Anderson-Schmidt, H. ; Kalman, J. ; Senner, F. ; Andlauer, T.F.M. ; Rietschel, M. ; Degenhardt, F. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Schulze, T.
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, 1161-1161 (2019)
Schulte, E. ; Kondofersky, I. ; Budde, M. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 29, 1257-1258 (2019)
Uzbas, F. ; Opperer, F. ; Sönmezer, C. ; Shaposhnikov, D. ; Sass, S. ; Krendl, C. ; Angerer, P. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Drukker, M.
Genome Biol. 20:155 (2019)
Czamara, D. ; Eraslan, G. ; Page, C.M. ; Lahti, J. ; Lahti-Pulkkinen, M. ; Hämäläinen, E. ; Kajantie, E. ; Laivuori, H. ; Villa, P.M. ; Reynolds, R.M. ; Nystad, W. ; Håberg, S.E. ; London, S.J. ; O'Donnell, K.J. ; Garg, E. ; Meaney, M.J. ; Entringer, S. ; Wadhwa, P.D. ; Buss, C. ; Jones, M.J. ; Lin, D.T.S. ; MacIsaac, J.L. ; Kobor, M.S. ; Koen, N. ; Zar, H.J. ; Koenen, K.C. ; Dalvie, S. ; Stein, D.J. ; Kondofersky, I. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Räikkönen, K. ; Binder, E.B.
Nat. Commun. 10:2548 (2019)
Behzadi, S. ; Müller, N.S. ; Plant, C. ; Böhm, C.
Lecture Notes Comp. Sci. 11439 LNAI, 555-573 (2019)
Eraslan, G. ; Simon, L. ; Mircea, M. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Nat. Commun. 10:390 (2019)
2018
Müller, N.S. ; Sass, S. ; Offermann, B. ; Singh, A. ; Knauer, S. ; Schüttler, A. ; Minardi, J.N. ; Theis, F.J. ; Busch, H. ; Boerries, M.
In: Lecture Notes in Bioengineering. 2018. 115-136
Krause, L. ; Brockow, K. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Müller, N.S. ; Eyerich, S.
Allergy 73, 731-731 (2018)
Lauffer, F. ; Jargosch, M. ; Krause, L. ; Garzorz-Stark, N. ; Franz, R. ; Roenneberg, S. ; Böhner, A. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol., accepted (2018)
Gonzalez-Vallinas, M. ; Rodriguez-Paredes, M. ; Albrecht, M. ; Sticht, C. ; Stichel, D. ; Gutekunst, J. ; Pitea, A. ; Sass, S. ; Sánchez-Rivera, F.J. ; Bermejo, J.L. ; Schmitt, J. ; De La Torre, C. ; Warth, A. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Gretz, N. ; Muley, T. ; Meister, M. ; Tschaharganeh, D.F. ; Schirmacher, P. ; Matthäus, F. ; Breuhahn, K.
Mol. Cancer Res. 16, 390-402 (2018)
Garzorz-Stark, N. ; Lauffer, F. ; Krause, L. ; Thomas, J. ; Atenhan, A. ; Franz, R. ; Roenneberg, S. ; Boehner, A. ; Jargosch, M. ; Batra, R. ; Müller, N.S. ; Haak, S. ; Groß, C. ; Groß, O. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Allergy Clin. Immunol. 141, 1320-1333.e11 (2018)
2017
Arloth, J. ; Binder, E. ; Müller, N.S.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, S163-S163 (2017)
Dirmeier, S. ; Fuchs, C. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 34, 896-898 (2017)
Sobotta, S. ; Raue, A. ; Huang, X. ; Vanlier, J. ; Jünger, A. ; Bohl, S. ; Albrecht, U. ; Hahnel, M.J. ; Wolf, S. ; Müller, N.S. ; D'Alessandro, L.A. ; Mueller-Bohl, S. ; Boehm, M.E. ; Lucarelli, P. ; Bonefas, S. ; Damm, G. ; Seehofer, D. ; Lehmann, W.D. ; Rose-John, S. ; van der Hoeven, F. ; Gretz, N. ; Theis, F.J. ; Ehlting, C. ; Bode, J.G. ; Timmer, J. ; Schilling, M. ; Klingmüller, U.
Front. Physiol. 8:775 (2017)
Krendl, C. ; Shaposhnikov, D. ; Rishko, V. ; Ori, C. ; Ziegenhain, C. ; Sass, S. ; Simon, L. ; Müller, N.S. ; Straub, T. ; Brooks, K.E. ; Chavez, S.L. ; Enard, W. ; Theis, F.J. ; Drukker, M.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 114, E9579-E9588 (2017)
Budde, M. ; Kondofersky, I. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Andlauer, T.F. ; Flatau, L. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S406 (2017)
Heilbronner, U. ; Jain, G. ; Kaurani, L. ; Kondofersky, I. ; Budde, M. ; Gade, K. ; Kalman, J. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Fischer, A. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S456-S457 (2017)
Comes, A. ; Aldinger, F. ; Kondofersky, I. ; Adorjan, K. ; Anderson-Schmidt, H. ; Andlauer, T.F. ; Budde, M. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S408-S409 (2017)
Schulte, E. ; Kondofersky, I. ; Budde, M. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Andlauer, T.F. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S401-S402 (2017)
Aichler, M. ; Borgmann, D.M. ; Krumsiek, J. ; Buck, A. ; MacDonald, P.E. ; Fox, J.E.M. ; Lyon, J. ; Light, P.E. ; Keipert, S. ; Jastroch, M. ; Feuchtinger, A. ; Müller, N.S. ; Sun, N. ; Palmer, A. ; Alexandrov, T. ; Hrabě de Angelis, M. ; Neschen, S. ; Tschöp, M.H. ; Walch, A.K.
Cell Metab. 25, 1334-1347.e4 (2017)
Kreimer, A. ; Zeng, H. ; Edwards, M.D. ; Guo, Y. ; Tian, K. ; Shin, S. ; Welch, R. ; Wainberg, M. ; Mohan, R. ; Sinnott-Armstrong, N.A. ; Li, Y. ; Eraslan, G. ; Amin, T.B. ; Goke, J. ; Müller, N.S. ; Kellis, M. ; Kundaje, A. ; Beer, M.A. ; Keles, S. ; Gifford, D.K. ; Yosef, N.
Hum. Mutat. 38, 1240-1250 (2017)
Kuepper, M.K. ; Thomas, J. ; Krause, L. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S. ; Garzorz-Stark, N.
Exp. Dermatol. 26, E69-E70 (2017)
Garzorz-Stark, N. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Atenhan, A. ; Thomas, J. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 26, E68-E68 (2017)
2016
González-Valllinas, M. ; Albrecht, M. ; Pitea, A. ; Rodriguez-Paredes, M. ; Stichel, D. ; Sass, S. ; Gutekunst, J. ; Schmitt, J. ; Muley, T. ; Meister, M. ; Warth, A. ; Schirmacher, P. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Matthäus, F. ; Breuhahn, K.
Cancer Res. 76 (2016)
Krause, L. ; Müller, N.S. ; Eyerich, S.
J. Allergy Clin. Immunol. 139, 1065-1066 (2016)
Thomas, J. ; Garzorz-Stark, N. ; Kuepper, L. ; Krause, L. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S.
Exp. Dermatol. 25, 27-28 (2016)
Kuepper, M.K. ; Thomas, J. ; Garzorz-Stark, N. ; Krause, L. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S.
J. Invest. Dermatol. 136, S217-S217 (2016)
Kong, B. ; Bruns, P. ; Behler, N.A. ; Chang, L. ; Schlitter, A.M. ; Cao, J. ; Gewies, A. ; Ruland, J. ; Fritzsche, S. ; Valkovskaya, N. ; Jian, Z. ; Regel, I. ; Raulefs, S. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Friess, H. ; Erkan, M. ; Müller, N.S. ; Roth, S. ; Hackert, T. ; Esposito, I. ; Theis, F.J. ; Kleeff, J. ; Michalski, C.W.
Gut 67, 146-156 (2016)
Garzorz-Stark, N. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Atenhan, A. ; Thomas, J. ; Stark, S.P. ; Franz, R. ; Weidinger, S. ; Balato, A. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 25, 767-774 (2016)
Krause, L. ; Mourantchanian, V. ; Brockow, K. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Knapp, B. ; Müller, N.S. ; Eyerich, S.
J. Allergy Clin. Immunol. 138, 1207-1210.e2 (2016)
Preusse, M. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S.
PLoS ONE 11:e0151771 (2016)
Stojcheva, N. ; Schechtmann, G. ; Sass, S. ; Roth, P. ; Florea, A.M. ; Stefanski, A. ; Stühler, K. ; Wolter, M. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Weller, M.G. ; Reifenberger, G. ; Happold, C.
Oncotarget 7, 12937-12950 (2016)
Willmann, S. ; Müller, N.S. ; Engert, S. ; Sterr, M. ; Burtscher, I. ; Raducanu, A. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.
Mech. Dev. 139, 51-64 (2016)
2015
Sass, S. ; Pitea, A. ; Unger, K. ; Hess, J. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Int. J. Mol. Sci. 16, 30204-30222 (2015)
Kovac, M. ; Blattmann, C. ; Ribi, S. ; Smida, J. ; Müller, N.S. ; Engert, F. ; Castro-Giner, F. ; Weischenfeldt, J. ; Kovacova, M. ; Krieg, A. ; Andreou, D. ; Tunn, P.U. ; Dürr, H.R. ; Rechl, H.P. ; Schaser, K.D. ; Melcher, I. ; Burdach, S. ; Kulozik, A. ; Specht, K. ; Heinimann, K. ; Fulda, S. ; Bielack, S. ; Jundt, G. ; Tomlinson, I. ; Korbel, J.O. ; Nathrath, M. ; Baumhoer, D.
Nat. Commun. 6:8940 (2015)
Meyer, S.U. ; Sass, S. ; Müller, N.S. ; Krebs, S. ; Bauersachs, S. ; Kaiser, S. ; Blum, H. ; Thirion, C. ; Krause, S. ; Theis, F.J. ; Pfaffl, M.W.
PLoS ONE 10:e0135284 (2015)
Ocone, A. ; Haghverdi, L. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 31, i89-i96 (2015)
Sass, S. ; Buettner, F. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 31, 128-130 (2015)
2013
Sass, S. ; Buettner, F. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Nucleic Acids Res. 41, 9622-9633 (2013)
2011
Müller, N.S. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Böhm, C. ; Meyer-Bäse, A.
Proc. SPIE 8058:805819 (2011)
2010
Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Plant, C. ; Böhm, C.
In: Vigneron, V.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Heidelberg: Springer, 2010. 466-473 (LNCS; 6365)
2004
Binder, E.B. ; Salyakina, D. ; Lichtner, P. ; Wochnik, G.M. ; Ising, M. ; Pütz, B. ; Papiol, S. ; Seaman, S. ; Lucae, S. ; Kohli, M.A. ; Nickel, T. ; Künzel, H.E. ; Fuchs, B. ; Majer, M. ; Pfennig, A. ; Kern, N. ; Brunner, J. ; Modell, S. ; Baghai, T. ; Deiml, T. ; Zill, P. ; Bondy, B. ; Rupprecht, R. ; Messer, T. ; Köhnlein, O. ; Dabitz, H. ; Brückl, T. ; Müller, N.S. ; Pfister, H. ; Lieb, R. ; Mueller, J.C. ; Löhmussaar, E. ; Strom, T.M. ; Bettecken, T. ; Meitinger, T. ; Uhr, M. ; Rein, T. ; Holsboer, F. ; Müller-Myhsok, B.
Nat. Genet. 36, 1319-1325 (2004)