Machine Learning

2018
Neschen, S. ; Wu, M. ; Fuchs, C. ; Kondofersky, I. ; Theis, F.J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Häring, H.-U. ; Sartorius, T.
Exp. Clin. Endocrinol. Diabet. 126, accepted (2018)
Pitea, A. ; Kondofersky, I. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Unger, K.
Brief. Bioinform., accepted (2018)
Tischler, J. ; Gruhn, W.H. ; Reid, J. ; Allgeyer, E. ; Buettner, F. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Simons, B.D. ; Wernisch, L. ; Surani, M.A.
EMBO J., accepted (2018)
Do, K.T. ; Wahl, S. ; Raffler, J. ; Molnos, S. ; Laimighofer, M. ; Adamski, J. ; Suhre, K. ; Strauch, K. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Langenberg, C. ; Stewart, I.D. ; Theis, F.J. ; Grallert, H. ; Kastenmüller, G. ; Krumsiek, J.
Metabolomics 14 (2018)
Feigelman, J ; Weindl, D. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Hasenauer, J.
In: Lecture Notes in Computer Science (16th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, 12-14 September 2018, Brno; Czech Republic). 2018. 300-306 ( ; 11095 LNBI)
Thomas, J. ; Kuepper, M.K. ; Batra, R. ; Jargosch, M. ; Atenhan, A. ; Baghin, V. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S. ; Garzorz-Stark, N.
Allergy 73, 732-733 (2018)
Jarasch, A. ; Glaser, A. ; Häring, H.-U. ; Roden, M. ; Schürmann, A. ; Solimena, M. ; Theis, F.J. ; Tschöp, M. ; Wess, G. ; Hrabě de Angelis, M.
Diabetologe, accepted (2018)
Ballnus, B. ; Schaper, S. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Bioinformatics 34, 494-501 (2018)
Colomé-Tatché, M. ; Theis, F.J.
Curr. Opin. Syst. Biol. 7, 54-59 (2018)
Strasser, M. ; Hoppe, P.S. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J. ; Marr, C.
Nat. Commun. 9:2697 (2018)
Thomas, J. ; Küpper, M. ; Batra, R. ; Jargosch, M. ; Atenhan, A. ; Baghin, V. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S. ; Garzorz-Stark, N.
J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol., accepted (2018)
Simon, L. ; Karg, S. ; Westermann, A.J. ; Engel, M. ; Elbehery, A.H.A. ; Hense, B.A. ; Heinig, M. ; Deng, L. ; Theis, F.J.
GigaScience 7:giy070 (2018)
Hastreiter, S. ; Skylaki, S. ; Loeffler, D. ; Reimann, A. ; Hilsenbeck, O. ; Hoppe, P.S. ; Coutu, D.L. ; Kokkaliaris, K.D. ; Schwarzfischer, M. ; Anastassiadis, K. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Stem Cell Rep. 10, 58-69 (2018)
Plass, M. ; Solana, J. ; Wolf, F. ; Ayoub, S. ; Misios, A. ; Glažar, P. ; Obermayer, B. ; Theis, F.J. ; Kocks, C. ; Rajewsky, N.
Science 360:eaaq1723 (2018)
Apweiler, R. ; Beissbarth, T. ; Berthold, M.R. ; Blüthgen, N. ; Burmeister, Y. ; Dammann, O. ; Deutsch, A.J. ; Feuerhake, F. ; Franke, A. ; Hasenauer, J. ; Hoffmann, S. ; Höfer, T. ; Jansen, P.L.M. ; Kaderali, L. ; Klingmüller, U. ; Koch, I. ; Kohlbacher, O. ; Kuepfer, L. ; Lammert, F. ; Maier, D. ; Pfeifer, N. ; Radde, N. ; Rehm, M. ; Roeder, I. ; Saez-Rodriguez, J. ; Sax, U. ; Schmeck, B.T. ; Schuppert, A. ; Seilheimer, B. ; Theis, F.J. ; Vera, J. ; Wolkenhauer, O.
Exp. Mol. Med. 50:e453 (2018)
Lauffer, F. ; Jargosch, M. ; Krause, L. ; Garzorz-Stark, N. ; Franz, R. ; Roenneberg, S. ; Böhner, A. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol., accepted (2018)
Benedetti, E. ; Pučić-Baković, M. ; Keser, T. ; Wahl, A. ; Hassinen, A. ; Yang, J.Y. ; Liu, L. ; Trbojević-Akmačić, I. ; Razdorov, G. ; Štambuk, J. ; Klarić, L. ; Ugrina, I. ; Selman, M.H.J. ; Wuhrer, M. ; Rudan, I. ; Polasek, O. ; Hayward, C. ; Grallert, H. ; Strauch, K. ; Peters, A. ; Meitinger, T. ; Gieger, C. ; Vilaj, M. ; Boons, G.J. ; Moremen, K.W. ; Ovchinnikova, T. ; Bovin, N. ; Kellokumpu, S. ; Theis, F.J. ; Lauc, G. ; Krumsiek, J.
Nat. Commun. 9:706 (2018)
Wolf, F. ; Angerer, P. ; Theis, F.J.
Genome Biol. 19:15 (2018)
Stirm, L. ; Huypens, P. ; Sass, S. ; Batra, R. ; Fritsche, L. ; Brucker, S. ; Abele, H. ; Hennige, A.M. ; Theis, F.J. ; Beckers, J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Fritsche, A. ; Häring, H.-U. ; Staiger, H.
Sci. Rep. 8:1366 (2018)
Gonzalez-Vallinas, M. ; Rodriguez-Paredes, M. ; Albrecht, M. ; Sticht, C. ; Stichel, D. ; Gutekunst, J. ; Pitea, A. ; Sass, S. ; Sánchez-Rivera, F.J. ; Bermejo, J.L. ; Schmitt, J. ; De La Torre, C. ; Warth, A. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Gretz, N. ; Muley, T. ; Meister, M. ; Tschaharganeh, D.F. ; Schirmacher, P. ; Matthäus, F. ; Breuhahn, K.
Mol. Cancer Res. 16, 390-402 (2018)
Dalke, C. ; Neff, F. ; Bains, S.K. ; Bright, S. ; Lord, D.J. ; Reitmeir, P. ; Rößler, U. ; Samaga, D. ; Unger, K. ; Braselmann, H. ; Wagner, F. ; Greiter, M. ; Gomolka, M. ; Hornhardt, S. ; Kunze, S. ; Kempf, S.J. ; Garrett, L. ; Hölter, S. ; Wurst, W. ; Rosemann, M. ; Azimzadeh, O. ; Tapio, S. ; Aubele, M. ; Theis, F.J. ; Hoeschen, C. ; Slijepcevic, P. ; Kadhim, M. ; Atkinson, M.J. ; Zitzelsberger, H. ; Kulka, U. ; Graw, J.
Radiat. Environ. Biophys. 57, 99-113 (2018)
Garzorz-Stark, N. ; Lauffer, F. ; Krause, L. ; Thomas, J. ; Atenhan, A. ; Franz, R. ; Roenneberg, S. ; Boehner, A. ; Jargosch, M. ; Batra, R. ; Müller, N.S. ; Haak, S. ; Groß, C. ; Groß, O. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Allergy Clin. Immunol. 141, 1320-1333.e11 (2018)
Frohnert, B.I. ; Laimighofer, M. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Winkler, C. ; Norris, J.M. ; Ziegler, A.-G. ; Rewers, M.J. ; Steck, A.K.
Pediatr. Diabetes 19, 277-283 (2018)
2017
Regev, A. ; Teichmann, S.A. ; Lander, E.S. ; Amit, I. ; Benoist, C. ; Birney, E. ; Bodenmiller, B. ; Campbell, P.J. ; Carninci, P. ; Clatworthy, M. ; Clevers, H. ; Deplancke, B. ; Dunham, I. ; Eberwine, J. ; Eils, R. ; Enard, W. ; Farmer, A. ; Fugger, L. ; Göttgens, B. ; Hacohen, N. ; Haniffa, M. ; Hemberg, M. ; Kim, S.K. ; Klenerman, P. ; Kriegstein, A. ; Lein, E. ; Linnarsson, S. ; Lundberg, E. ; Lundeberg, J. ; Majumder, P. ; Marioni, J.C. ; Merad, M. ; Mhlanga, M. ; Nawijn, M.C. ; Netea, M. ; Nolan, G. ; Pe'er, D. ; Phillipakis, A. ; Ponting, C.P. ; Quake, S.R. ; Reik, W. ; Rozenblatt-Rosen, O. ; Sanes, J.R. ; Satija, R. ; Schumacher, T.N. ; Shalek, A.K. ; Shapiro, E. ; Sharma, P. ; Shin, J.W. ; Stegle, O. ; Stratton, M.R. ; Stubbington, M.J.T. ; Theis, F.J. ; Uhlén, M. ; van Oudenaarden, A. ; Wagner, A. ; Watt, F.M. ; Weissman, J.S. ; Wold, B.J. ; Xavier, R.J. ; Yosef, N.
eLife 6:e27041 (2017)
Benedetti, E. ; Pučić-Baković, M. ; Keser, T. ; Wahl, A. ; Hassinen, A. ; Yang, J.Y. ; Liu, L. ; Trbojević-Akmačić, I. ; Razdorov, G. ; Štambuk, J. ; Klarić, L. ; Ugrina, I. ; Selman, M.H.J. ; Wuhrer, M. ; Rudan, I. ; Polasek, O. ; Hayward, C. ; Grallert, H. ; Strauch, K. ; Peters, A. ; Meitinger, T. ; Gieger, C. ; Vilaj, M. ; Boons, G.J. ; Moremen, K.W. ; Ovchinnikova, T. ; Bovin, N. ; Kellokumpu, S. ; Theis, F.J. ; Lauc, G. ; Krumsiek, J.
Nat. Commun. 8:1483 (2017)
Dirmeier, S. ; Fuchs, C. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 34, 896-898 (2017)
Sobotta, S. ; Raue, A. ; Huang, X. ; Vanlier, J. ; Jünger, A. ; Bohl, S. ; Albrecht, U. ; Hahnel, M.J. ; Wolf, S. ; Müller, N.S. ; D'Alessandro, L.A. ; Mueller-Bohl, S. ; Boehm, M.E. ; Lucarelli, P. ; Bonefas, S. ; Damm, G. ; Seehofer, D. ; Lehmann, W.D. ; Rose-John, S. ; van der Hoeven, F. ; Gretz, N. ; Theis, F.J. ; Ehlting, C. ; Bode, J.G. ; Timmer, J. ; Schilling, M. ; Klingmüller, U.
Front. Physiol. 8:775 (2017)
Krendl, C. ; Shaposhnikov, D. ; Rishko, V. ; Ori, C. ; Ziegenhain, C. ; Sass, S. ; Simon, L. ; Müller, N.S. ; Straub, T. ; Brooks, K.E. ; Chavez, S.L. ; Enard, W. ; Theis, F.J. ; Drukker, M.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 114, E9579-E9588 (2017)
Förster, K. ; Sass, S. ; Ehrhardt, H. ; Mous, D.S. ; Rottier, R.J. ; Oak, P. ; Schulze, A. ; Flemmer, A.W. ; Gronbach, J. ; Hübener, C. ; Desai, T. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Hilgendorff, A.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 197, 1076-1080 (2017)
Angerer, P. ; Simon, L. ; Tritschler, S. ; Wolf, F. ; Fischer, D. ; Theis, F.J.
Curr. Opin. Syst. Biol. 4, 85-91 (2017)
Molnos, S. ; Baumbach, C. ; Wahl, S. ; Müller-Nurasyid, M. ; Strauch, K. ; Wang-Sattler, R. ; Waldenberger, M. ; Meitinger, T. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Suhre, K. ; Peters, A. ; Grallert, H. ; Theis, F.J. ; Gieger, C.
BMC Bioinformatics 18:429 (2017)
Garzorz-Stark, N. ; Lauffer, F. ; Krause, L. ; Gross, O. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol. 137, S275-S275 (2017)
Lauffer, F. ; Jargosch, M. ; Krause, L. ; Garzorz-Stark, N. ; Franz, R. ; Roenneberg, S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol. 137, S254-S254 (2017)
Eulenberg, P. ; Köhler, N. ; Blasi, T. ; Filby, A. ; Carpenter, A.E. ; Rees, P. ; Theis, F.J. ; Wolf, F.
Nat. Commun. 8:463 (2017)
Krautenbacher, N. ; Theis, F.J. ; Fuchs, C.
Comput. Math. Methods Med. 2017:7847531 (2017)
Tritschler, S. ; Theis, F.J. ; Lickert, H. ; Böttcher, A.
Mol. Metab. 6, 974-990 (2017)
Budde, M. ; Kondofersky, I. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Andlauer, T.F. ; Flatau, L. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S406 (2017)
Heilbronner, U. ; Jain, G. ; Kaurani, L. ; Kondofersky, I. ; Budde, M. ; Gade, K. ; Kalman, J. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Fischer, A. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S456-S457 (2017)
Comes, A. ; Aldinger, F. ; Kondofersky, I. ; Adorjan, K. ; Anderson-Schmidt, H. ; Andlauer, T.F. ; Budde, M. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S408-S409 (2017)
Schulte, E. ; Kondofersky, I. ; Budde, M. ; Adorjan, K. ; Aldinger, F. ; Anderson-Schmidt, H. ; Andlauer, T.F. ; Gade, K. ; Heilbronner, U. ; Kalman, J. ; Papiol, S. ; Theis, F.J. ; Falkai, P. ; Müller, N.S. ; Schulze, T.G.
Eur. Neuropsychopharmacol. 27, 3, S401-S402 (2017)
Kazeroonian, A. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Bioinformatics 33, i293-i300 (2017)
Peng, T. ; Thorn, K. ; Schroeder, T. ; Wang, L. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Navab, N.
Nat. Commun. 8:14836 (2017)
Milger, K. ; Götschke, J. ; Krause, L. ; Nathan, P. ; Alessandrini, F. ; Tufman, A. ; Fischer, R. ; Bartel, S. ; Theis, F.J. ; Behr, J. ; Dehmel, S. ; Müller, N.S. ; Kneidinger, N. ; Krauss-Etschmann, S.
Allergy 72, 1962-1971 (2017)
Ballnus, B. ; Hug, S. ; Hatz, K. ; Görlitz, L. ; Hasenauer, J. ; Theis, F.J.
BMC Syst. Biol. 11:63 (2017)
Conlon, T.M. ; Hackl, M. ; Bartel, J. ; Krumsiek, J. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Theis, F.J. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 195 (2017)
Bartel, S. ; Schulz, N. ; Alessandrini, F. ; Schamberger, A.C. ; Pagel, P. ; Theis, F.J. ; Milger, K. ; Nößner, E. ; Stick, S.M. ; Kicic, A. ; Eickelberg, O. ; Freishtat, R.J. ; Krauss-Etschmann, S.
Sci. Rep. 7:46026 (2017)
Chlis, N.-K. ; Wolf, F. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 33, 3211-3219 (2017)
Hilgendorff, A. ; Foerster, K. ; Sass, S. ; Stoecklein, S. ; Dietrich, O. ; Pomschar, A. ; Schulze, A. ; Huebener, C. ; Theis, F.J. ; Erhardt, H. ; Flemmer, A.W. ; Ertl-Wagner, B.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 195 (2017)
Piasecka, J. ; Hennig, H. ; Theis, F.J. ; Rees, P. ; Summers, H.D. ; Thornton, C.A.
J. Allergy Clin. Immunol. 139, AB163-AB163 (2017)
Florea, A.M. ; Varghese, E. ; McCallum, J.E. ; Mahgoub, S. ; Helmy, I. ; Varghese, S. ; Gopinath, N. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Reifenberger, G. ; Büsselberg, D.
Oncotarget 8, 22876-22893 (2017)
Kuepper, M.K. ; Thomas, J. ; Krause, L. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S. ; Garzorz-Stark, N.
Exp. Dermatol. 26, E69-E70 (2017)
Garzorz-Stark, N. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Atenhan, A. ; Thomas, J. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 26, E68-E68 (2017)
Lauffer, F. ; Krause, L. ; Franz, R. ; Garzorz-Stark, N. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 26, E61-E61 (2017)
Blasi, T. ; Buettner, F. ; Strasser, M. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
Phys. Biol. 14:036001 (2017)
Hilsenbeck, O. ; Schwarzfischer, M. ; Loeffler, D. ; Dimopoulos, S. ; Hastreiter, S. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Bioinformatics 33, 2020-2028 (2017)
Buggenthin, F. ; Buettner, F. ; Hoppe, P.S. ; Endele, M. ; Kroiss, M. ; Strasser, M. ; Schwarzfischer, M. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Hilsenbeck, O. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J. ; Marr, C.
Nat. Methods, DOI: 10.1038/nmeth.4182 (2017)
Jagiella, N. ; Rickert, D. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Cell Syst. 4, 194–206.e9 (2017)
Fröhlich, F. ; Theis, F.J. ; Rädler, J.O. ; Hasenauer, J.
Bioinformatics 33, 1049-1056 (2017)
Fröhlich, F. ; Kaltenbacher, B. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
PLoS Comput. Biol. 13:e1005331 (2017)
von Toerne, C. ; Laimighofer, M. ; Achenbach, P. ; Beyerlein, A. ; de Las Heras Gala, T. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G. ; Hauck, S.M.
Diabetologia 60, 287-295 (2017)
Senís, E. ; Mockenhaupt, S. ; Rupp, D. ; Bauer, T. ; Paramasivam, N. ; Knapp, B. ; Gronych, J. ; Grosse, S.D. ; Windisch, M.P. ; Schmidt, F. ; Theis, F.J. ; Eils, R. ; Lichter, P. ; Schlesner, M. ; Bartenschlager, R. ; Grimm, D.
Nucleic Acids Res. 45:e3 (2017)
2016
Förster, K. ; Sass, S. ; Dietrich, O. ; Pomschar, A. ; Nährlich, L. ; Schulze, A. ; Flemmer, A.W. ; Ehrhardt, H. ; Hübener, C. ; Eickelberg, O. ; Theis, F.J. ; Ertl-Wagner, B. ; Hilgendorff, A.
Eur. Respir. J. 48, PP104 (2016)
Much, D. ; Beyerlein, A. ; Kindt, A. ; Krumsiek, J. ; Rossbauerl, M. ; Hofelich, A. ; Hivner, S. ; Herbst, M. ; Römisch-Margl, W. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G. ; Hummel, S.
Diabetologia 59, S187-S187 (2016)
Stoecker, K. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Hauner, H. ; Pfaffl, M.W.
Biomol. Detect. Quantif. 11, 31-44 (2016)
Huypens, P. ; Sass, S. ; Wu, M. ; Dyckhoff, D. ; Tschöp, M. ; Theis, F.J. ; Marschall, S. ; Hrabě de Angelis, M. ; Beckers, J.
Obstet. Gynecol. Surv. 71, 719-720 (2016)
Luber, B. ; Keller, S. ; Zwingenberger, G. ; Ebert, K. ; Maier, D. ; Geier, B. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J. ; Huge, S. ; Meyer-Hermann, M. ; Dehghany, J. ; Walch, A.K. ; Aichler, M. ; Lordick, F. ; Haffner, I.
Eur. J. Cancer 68, S135-S135 (2016)
Fröhlich, F. ; Shadrin, A. ; Kessler, T. ; Wierling, C. ; Heinig, M. ; Theis, F.J. ; Lange, B.M. ; Lehrach, H. ; Hasenauer, J.
Eur. J. Cancer 68, S44-S44 (2016)
Hross, S. ; Fiedler, A. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
In: (Foundations of Systems Biology in Engineering - FOSBE 2016, 9—12 October 2016, Magdeburg). 2016. 264-269 (IFAC PapersOnline ; 49-26)
Kong, B. ; Bruns, P. ; Behler, N. ; Schlitter, A.M. ; Friess, H. ; Erkan, M. ; Theis, F.J. ; Esposito, I. ; Michalski, C.W. ; Kleeff, J.
Pancreatol. 16, S. 11 (2016)
González-Valllinas, M. ; Albrecht, M. ; Pitea, A. ; Rodriguez-Paredes, M. ; Stichel, D. ; Sass, S. ; Gutekunst, J. ; Schmitt, J. ; Muley, T. ; Meister, M. ; Warth, A. ; Schirmacher, P. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Matthäus, F. ; Breuhahn, K.
Cancer Res. 76 (2016)
Sacher, A. ; Theis, F.J.
Laborpraxis, DOI: undefined (2016)
Theis, F.J.
https://www.bsse.ethz.ch/csd/software/ttt-and-qtfy.html (2016)
Feigelman, J. ; Ganscha, S. ; Hastreiter, S. ; Schwarzfischer, M. ; Filipczyk, A. ; Schröder, T. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Claassen, M.
Cell Syst. 3, 480-490 (2016)
Bortsova, G. ; Sterr, M. ; Wang, L. ; Milletari, F. ; Navab, N. ; Böttcher, A. ; Lickert, H. ; Theis, F.J. ; Peng, T.
Lecture Notes Comp. Sci. 10019, 287-295 (2016)
Thomas, J. ; Garzorz-Stark, N. ; Kuepper, L. ; Krause, L. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S.
Exp. Dermatol. 25, 27-28 (2016)
Lauffer, F. ; Krause, L. ; Franz, R. ; Garzorz-Stark, N. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 25, 30-31 (2016)
Kuepper, M.K. ; Thomas, J. ; Garzorz-Stark, N. ; Krause, L. ; Müller, N.S. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, K. ; Eyerich, S.
J. Invest. Dermatol. 136, S217-S217 (2016)
Lauffer, F. ; Krause, L. ; Franz, R. ; Garzorz-Stark, N. ; Biedermann, T. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol. 136, S219-S219 (2016)
Kong, B. ; Bruns, P. ; Behler, N.A. ; Chang, L. ; Schlitter, A.M. ; Cao, J. ; Gewies, A. ; Ruland, J. ; Fritzsche, S. ; Valkovskaya, N. ; Jian, Z. ; Regel, I. ; Raulefs, S. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Friess, H. ; Erkan, M. ; Müller, N.S. ; Roth, S. ; Hackert, T. ; Esposito, I. ; Theis, F.J. ; Kleeff, J. ; Michalski, C.W.
Gut 67, 146-156 (2016)
Fiedler, A. ; Raeth, S. ; Theis, F.J. ; Hausser, A. ; Hasenauer, J.
BMC Syst. Biol. 10:80 (2016)
Haghverdi, L. ; Büttner, M. ; Wolf, F. ; Buettner, F. ; Theis, F.J.
Nat. Methods 13, 845-848 (2016)
Carpenter, A. ; Eddy, S.E. ; Flicek, P. ; Gymrek, M. ; Hammell, M. ; Jaqaman, K. ; Jenkins, J. ; Koller, D. ; Lappalainen, T. ; Oshlack, A. ; Shamir, R. ; Singh, M. ; Teichmann, S. ; Theis, F.J. ; Troyanskaya, O.
Cell Syst. 3, 7-11 (2016)
Fröhlich, F. ; Thomas, P. ; Kazeroonian, A. ; Theis, F.J. ; Grima, R. ; Hasenauer, J.
PLoS Comput. Biol. 12:e1005030 (2016)
Sacher, A. ; Theis, F.J.
Laborjournal 7-8, 59-61 (2016)
Much, D. ; Beyerlein, A. ; Kindt, A. ; Krumsiek, J. ; Stückler, F. ; Rossbauer, M. ; Hofelich, A. ; Wiesenäcker, D. ; Hivner, S. ; Herbst, M. ; Römisch-Margl, W. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G. ; Hummel, S.
Diabetologia 59, 2193-2202 (2016)
Hilsenbeck, O. ; Schwarzfischer, M. ; Skylaki, S. ; Schauberger, B. ; Hoppe, P.S. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Hastreiter, S. ; Skylaki, E. ; Filipczyk, A. ; Strasser, M. ; Buggenthin, F. ; Feigelman, J. ; Krumsiek, J. ; van den Berg, A.J. ; Endele, M. ; Etzrodt, M. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Nat. Biotechnol. 34, 703-706 (2016)
Hoppe, P.S. ; Schwarzfischer, M. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Hilsenbeck, O. ; Moritz, N. ; Endele, M. ; Filipczyk, A. ; Gambardella, A. ; Ahmed, N. ; Etzrodt, M. ; Coutu, D.L. ; Rieger, M.A. ; Marr, C. ; Strasser, M. ; Schauberger, B. ; Burtscher, I. ; Ermakova, O. ; Bürger, A. ; Lickert, H. ; Nerlov, C. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Nature 535, 299-302 (2016)
Scheel, C. ; Linnemann, J.R. ; Miura, H. ; Meixner, L.K. ; Irmier, M. ; Kloos, U.J. ; Hirschi, B. ; Bartsch, H.S. ; Sass, S. ; Beckers, J. ; Theis, F.J. ; Gabka, C. ; Sotlar, K.
Cancer Res. 76:P1-06-02 (2016)
Garzorz-Stark, N. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Atenhan, A. ; Thomas, J. ; Stark, S.P. ; Franz, R. ; Weidinger, S. ; Balato, A. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Biedermann, T. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 25, 767-774 (2016)
Styczynski, M.P. ; Theis, F.J.
Curr. Opin. Biotechnol. 39, IV-VI (2016)
Krause, L. ; Mourantchanian, V. ; Brockow, K. ; Theis, F.J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Knapp, B. ; Müller, N.S. ; Eyerich, S.
J. Allergy Clin. Immunol. 138, 1207-1210.e2 (2016)
Theis, F.J.
Laborjournal 23, 22-25 (2016)
Krumsiek, J. ; Bartel, J. ; Theis, F.J.
Curr. Opin. Biotechnol. 39, 198-206 (2016)
Geissen, E.M. ; Hasenauer, J. ; Heinrich, S. ; Hauf, S. ; Theis, F.J. ; Radde, N.
Bioinformatics 32, 2464-2472 (2016)
Kondofersky, I. ; Theis, F.J. ; Fuchs, C.
IET Syst. Biol. 10, 210-218 (2016)
Rolle-Kampczyk, U.E. ; Krumsiek, J. ; Otto, W. ; Röder, S.W. ; Kohajda, T. ; Borte, M. ; Theis, F.J. ; Lehmann, I. ; von Bergen, M.
Metabolomics 12:76 (2016)
Haffner, I. ; Luber, B. ; Maier, D. ; Geier, B. ; Theis, F.J. ; Meyer-Hermann, M. ; Walch, A.K. ; Kretzschmar, A.K. ; von Weikersthal, L.F. ; Knorrenschild, J.R. ; Schierle, K. ; Wittekind, C. ; Lordick, F.
Oncol. Res. Treat. 39, 16-17 (2016)
Preusse, M. ; Theis, F.J. ; Müller, N.S.
PLoS ONE 11:e0151771 (2016)
Huypens, P. ; Sass, S. ; Wu, M. ; Dyckhoff, D. ; Tschöp, M. ; Theis, F.J. ; Marschall, S. ; Hrabě de Angelis, M. ; Beckers, J.
Nat. Genet. 48, 497-499 (2016)
Laimighofer, M. ; Krumsiek, J. ; Buettner, F. ; Theis, F.J.
J. Comput. Biol. 23, 279-290 (2016)
Kazeroonian, A. ; Fröhlich, F. ; Raue, A. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
PLoS ONE 11:e0146732 (2016)
Jung, B. ; Padula, D. ; Burtscher, I. ; Landerer, C. ; Lutter, D. ; Theis, F.J. ; Messias, A.C. ; Geerlof, A. ; Sattler, M. ; Kremmer, E. ; Boldt, K. ; Ueffing, M. ; Lickert, H.
PLoS ONE 11:e0149477 (2016)
Stojcheva, N. ; Schechtmann, G. ; Sass, S. ; Roth, P. ; Florea, A.M. ; Stefanski, A. ; Stühler, K. ; Wolter, M. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J. ; Weller, M.G. ; Reifenberger, G. ; Happold, C.
Oncotarget 7, 12937-12950 (2016)
Blasi, T. ; Feller, C. ; Feigelman, J. ; Hasenauer, J. ; Imhof, A. ; Theis, F.J. ; Becker, P.B. ; Marr, C.
Cell Syst. 2, 49-58 (2016)
Blasi, T. ; Hennig, H. ; Summers, H.D. ; Theis, F.J. ; Cerveira, J. ; Patterson, J.O. ; Davies, D. ; Filby, A. ; Carpenter, A.E. ; Rees, P.
Nat. Commun. 7:10256 (2016)
Hug, S. ; Schmidl, D. ; Li, W.B. ; Greiter, M. ; Theis, F.J.
In: Geris, L.* ; Gomez-Cabrero, D.* [Eds.]: Uncertainty in Biology : A Computational Modeling Approach. Berlin; Heidelberg: Springer, 2016. 243-268 (Stud. Mechanobiol. Tiss. Engineering Biomater. ; 17)
Angerer, P. ; Haghverdi, L. ; Büttner, M. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Buettner, F.
Bioinformatics 32, 1241-1243 (2016)
Willmann, S. ; Müller, N.S. ; Engert, S. ; Sterr, M. ; Burtscher, I. ; Raducanu, A. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.
Mech. Dev. 139, 51-64 (2016)
Zissler, U.M. ; Chaker, A.M. ; Effner, R. ; Ulrich, M. ; Guerth, F. ; Piontek, G. ; Dietz, K. ; Regn, M. ; Knapp, B. ; Theis, F.J. ; Heine, H. ; Suttner, K. ; Schmidt-Weber, C.B.
Mucosal Immunol. 9, 917-926 (2016)
Conlon, T.M. ; Bartel, J. ; Ballweg, K. ; Günter, S. ; Prehn, C. ; Krumsiek, J. ; Meiners, S. ; Theis, F.J. ; Adamski, J. ; Eickelberg, O. ; Yildirim, A.Ö.
Clin. Sci. 130, 273-287 (2016)
Miettinen, J. ; Illner, K. ; Nordhausen, K. ; Oja, H. ; Taskinen, S. ; Theis, F.J.
J. Time Ser. Anal. 37, 337-354 (2016)
Kong, B. ; Wu, W. ; Cheng, T. ; Schlitter, A.M. ; Qian, C. ; Bruns, P. ; Jian, Z. ; Jager, C. ; Regel, I. ; Raulefs, S. ; Behler, N. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Friess, H. ; Erkan, M. ; Siveke, J.T. ; Tannapfel, A. ; Hahn, S.A. ; Theis, F.J. ; Esposito, I. ; Kleeff, J. ; Michalski, C.W.
Gut 65, 647-657 (2016)
2015
Bartel, S. ; Schulz, N. ; Schamberger, A.C. ; Alessandrini, F. ; Pagel, P. ; Theis, F.J. ; Milger, K. ; Nößner, E. ; Stick, S.M. ; Kicic, A. ; Eickelberg, O. ; Freishtat, R.J. ; Krauss-Etschmann, S.
In:. 2015. 69-A24 (Pneumologe)
Sass, S. ; Pitea, A. ; Unger, K. ; Hess, J. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Int. J. Mol. Sci. 16, 30204-30222 (2015)
Wang, L. ; Belagiannis, V. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Yang, G.Z. ; Navab, N.
In: Proceedings (12th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2015, 16-19 April 2015, Brooklyn, United States). 2015. 1304-1307
Loos, C. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Lecture Notes Comp. Sci. 9308, 52-63 (2015)
Preusse, M. ; Marr, C. ; Saunders, S. ; Maticzka, D. ; Lickert, H. ; Backofen, R. ; Theis, F.J.
RNA Biol. 12, 998-1009 (2015)
Filipczyk, A. ; Marr, C. ; Hastreiter, S. ; Feigelman, J. ; Schwarzfischer, M. ; Hoppe, P.S. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Endele, M. ; Schauberger, B. ; Hilsenbeck, O. ; Skylaki, S. ; Hasenauer, J. ; Anastassiadis, K. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Nat. Cell Biol. 17, 1235-1246 (2015)
Strasser, M. ; Feigelman, J. ; Theis, F.J. ; Marr, C.
BMC Syst. Biol. 9:61 (2015)
Ilmonen, P. ; Nordhausen, K. ; Oja, H. ; Theis, F.J.
Lecture Notes Comp. Sci. 9237, 328-335 (2015)
Garzorz, N.V. ; Krause, L. ; Lauffer, F. ; Atenhan, A. ; Thomas, J. ; Theis, F.J. ; Biedermann, T. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol. 135, S1 (2015)
Meyer, S.U. ; Sass, S. ; Müller, N.S. ; Krebs, S. ; Bauersachs, S. ; Kaiser, S. ; Blum, H. ; Thirion, C. ; Krause, S. ; Theis, F.J. ; Pfaffl, M.W.
PLoS ONE 10:e0135284 (2015)
Krumsiek, J. ; Mittelstraß, K. ; Do, K.T. ; Stückler, F. ; Ried, J.S. ; Adamski, J. ; Peters, A. ; Illig, T. ; Kronenberg, F. ; Friedrich, N. ; Nauck, M. ; Pietzner, M. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Suhre, K. ; Gieger, C. ; Grallert, H. ; Theis, F.J. ; Kastenmüller, G.
Metabolomics 11, 1815-1833 (2015)
Müller, S. ; Raulefs, S. ; Bruns, P. ; Afonso-Grunz, F. ; Plötner, A. ; Thermann, R. ; Jager, C. ; Schlitter, A.M. ; Kong, B. ; Regel, I. ; Roth, W.K. ; Rotter, B. ; Hoffmeier, K. ; Kahl, G.F. ; Koch, I. ; Theis, F.J. ; Kleeff, J. ; Winter, P. ; Michalski, C.W.
Mol. Cancer 14:144 (2015)
Raue, A. ; Steiert, B. ; Schelker, M. ; Kreutz, C. ; Maiwald, T. ; Hass, H. ; Vanlier, J. ; Tönsing, C. ; Adlung, L. ; Engesser, R. ; Mader, W. ; Heinemann, T. ; Hasenauer, J. ; Schilling, M. ; Höfer, T. ; Klipp, E. ; Theis, F.J. ; Klingmüller, U. ; Schöberl, B. ; Timmer, J.
Bioinformatics 31, 3558-3560 (2015)
Hasenauer, J. ; Jagiella, N. ; Hross, S. ; Theis, F.J.
J. Coupled Syst. Multiscale Dyn. 3, 101-121 (2015)
Masserdotti, G. ; Gillotin, S. ; Sutor, B. ; Drechsel, D. ; Irmler, M. ; Jørgensen, H.F. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Beckers, J. ; Berninger, B. ; Guillemot, F. ; Götz, M.
Cell Stem Cell 17, 74-88 (2015)
Bartel, J. ; Krumsiek, J. ; Schramm, K. ; Adamski, J. ; Gieger, C. ; Herder, C. ; Carstensen, M. ; Peters, A. ; Rathmann, W. ; Roden, M. ; Strauch, K. ; Suhre, K. ; Kastenmüller, G. ; Prokisch, H. ; Theis, F.J.
PLoS Genet. 11:e1005274 (2015)
Ocone, A. ; Haghverdi, L. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 31, i89-i96 (2015)
Linnemann, J. ; Miura, H. ; Meixner, L.K. ; Irmler, M. ; Kloos, U. ; Hirschi, B. ; Bartsch, H.S. ; Sass, S. ; Beckers, J. ; Theis, F.J. ; Gabka, C. ; Sotlar, K. ; Scheel, C.
Development 142, 3239-3251 (2015)
Sadic, D. ; Schmidt, K. ; Groh, S. ; Kondofersky, I. ; Ellwart, J.W. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J. ; Schotta, G.
EMBO Rep. 16, 836-850 (2015)
Wilson, N.K. ; Kent, D.G. ; Buettner, F. ; Shehata, M. ; Macaulay, I.C. ; Calero-Nieto, F.J. ; Sánchez Castillo, M. ; Oedekoven, C.A. ; Diamanti, E. ; Schulte, R. ; Ponting, C.P. ; Voet, T. ; Caldas, C. ; Stingl, J. ; Green, A.R. ; Theis, F.J. ; Göttgens, B.
Cell Stem Cell 16, 712-724 (2015)
Haghverdi, L. ; Buettner, F. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 31, 2989-2998 (2015)
Barbosa, J.S. ; Sanchez-Gonzalez, R. ; di Giaimo, R. ; Baumgart, E.V. ; Theis, F.J. ; Götz, M. ; Ninkovic, J.
Science 348, 789-793 (2015)
Kondofersky, I. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J.
IET Syst. Biol. 9, 193-203 (2015)
Müller, S. ; Raulefs, S. ; Bruns, P. ; Afonso-Grunz, F. ; Plötner, A. ; Thermann, R. ; Jager, C. ; Schlitter, A.M. ; Kong, B. ; Regel, I. ; Roth, W.K. ; Rotter, B. ; Hoffmeier, K. ; Kahl, G.F. ; Koch, I. ; Theis, F.J. ; Kleeff, J. ; Winter, P. ; Michalski, C.W.
Mol. Cancer 14:94 (2015)
Helmbrecht, M.S. ; Soellner, H. ; Castiblanco-Urbina, M.A. ; Winzeck, S. ; Sundermeier, J. ; Theis, F.J. ; Fouad, K. ; Huber, A.B.
PLoS ONE 10:e0123643 (2015)
Theis, F.J. ; Ugelvig, L.V. ; Marr, C. ; Cremer, S.
Philos. Trans. R. Soc. B - Biol. Sci. 370, DOI: 10.1098/rstb.2014.0108 (2015)
Wahl, S. ; Vogt, S. ; Stückler, F. ; Krumsiek, J. ; Bartel, J. ; Kacprowski, T. ; Schramm, K. ; Carstensen, M. ; Rathmann, W. ; Roden, M. ; Jourdan, C. ; Kangas, A.J. ; Soininen, P. ; Ala-Korpela, M. ; Nöthlings, U. ; Boeing, H. ; Theis, F.J. ; Meisinger, C. ; Waldenberger, M. ; Suhre, K. ; Homuth, G. ; Gieger, C. ; Kastenmüller, G. ; Illig, T. ; Linseisen, J. ; Peters, A. ; Prokisch, H. ; Herder, C. ; Thorand, B. ; Grallert, H.
BMC Med. 13:48 (2015)
Hug, S. ; Schwarzfischer, M. ; Hasenauer, J. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
Stat. Comp. 26, 663-677 (2015)
Calzolari, F. ; Michel, J. ; Baumgart, E.V. ; Theis, F.J. ; Götz, M. ; Ninkovic, J.
Nat. Neurosci. 18, 490-492 (2015)
Moignard, V. ; Woodhouse, S. ; Haghverdi, L. ; Lilly, A.J. ; Tanaka, Y. ; Wilkinson, A.C. ; Buettner, F. ; Macaulay, I.C. ; Jawaid, W. ; Diamanti, E. ; Nishikawa, S.I. ; Piterman, N. ; Kouskoff, V. ; Theis, F.J. ; Fisher, J. ; Gottgens, B.
Nat. Biotechnol. 33, 269-276 (2015)
Illner, K. ; Miettinen, J. ; Fuchs, C. ; Taskinen, S. ; Nordhausen, K. ; Oja, H. ; Theis, F.J.
Signal Process. 113, 95-103 (2015)
Kong, B. ; Bruns, P. ; Raulefs, S. ; Rieder, S. ; Paul, L. ; da Costa, O.P. ; Buch, T. ; Theis, F.J. ; Michalski, C.W. ; Kleeff, J.
Int. J. Surg. 14, 67-74 (2015)
Buettner, F. ; Natarajan, K.N. ; Casale, F.P. ; Proserpio, V. ; Scialdone, A. ; Theis, F.J. ; Teichmann, S.A. ; Marioni, J.C. ; Stegle, O.
Nat. Biotechnol. 33, 155-160 (2015)
Schmidt, J. ; Panzilius, E. ; Bartsch, H.S. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Kari, V. ; Linnemann, J. ; Dragoi, D. ; Hirschi, B. ; Kloos, U. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Kahlert, S. ; Johnsen, S.A. ; Sotlar, K. ; Scheel, C.
Cell Rep. 10, 131-139 (2015)
Do, K.T. ; Kastenmüller, G. ; Mook-Kanamori, D.O. ; Yousri, N.A. ; Theis, F.J. ; Suhre, K. ; Krumsiek, J.
J. Proteome Res. 14, 1183-1194 (2015)
Sass, S. ; Buettner, F. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 31, 128-130 (2015)
2014
Kazeroonian, A. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
IFAC PapersOnline 19, 1729-1735 (2014)
Reversat, A. ; Buggenthin, F. ; Merrin, J. ; Leithner, A. ; de Vries, I. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Sixt, M.
Mol. Biol. Cell 25:P537 (2014)
Quaranta, M. ; Knapp, B. ; Garzoz, N. ; Mattii, M. ; Pullabhatla, V. ; Pennino, D. ; Andres, C. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Cavani, A. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Br. J. Dermatol. 171, E135 (2014)
Fröhlich, F. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Lecture Notes Comp. Sci. 8859, 61-72 (2014)
Fröhlich, F. ; Hross, S. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Lecture Notes Comp. Sci. 8859, 73-85 (2014)
Winkler, C. ; Krumsiek, J. ; Buettner, F. ; Angermüller, C. ; Giannopoulou, E.Z. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G. ; Bonifacio, E.
Diabetologia 58, 206 (2014)
Waldera-Lupa, D.M. ; Kalfalah, F. ; Florea, A.M. ; Sass, S. ; Kruse, F.E. ; Rieder, V. ; Tigges, J. ; Fritsche, E. ; Krutmann, J. ; Busch, H. ; Boerries, M. ; Meyer, H.E. ; Boege, F. ; Theis, F.J. ; Reifenberger, G. ; Stühler, K.
Aging 6, 856-878 (2014)
Khakhutskyy, V. ; Schwarzfischer, M. ; Hubig, N. ; Plant, C. ; Marr, C. ; Rieger, M.A. ; Schröder, T. ; Theis, F.J.
Lecture Notes Comp. Sci. 8649, 15-29 (2014)
Illner, K. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J.
In: Gillli, M.* ; Gonzalez-Rodriguez, G.* ; Nieto-Reyes, A.* [Eds.]: Proccedings (21st International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT2014), 19-22 August 2014, Geneva, Switzerland). 2014. 625-632
Illner, K. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J.
Sep. Sci. Appl. 34, 24-26 (2014)
Illner, K. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J.
GIT Fachz. Lab. 9, 28-30 (2014)
Illner, K. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J.
J. Comput. Biol. 21, 855-865 (2014)
Röck, K. ; Tigges, J. ; Sass, S. ; Schütze, A. ; Florea, A.M. ; Fender, A.C. ; Theis, F.J. ; Krutmann, J. ; Boege, F. ; Fritsche, E. ; Reifenberger, G. ; Fischer, J.W.
J. Invest. Dermatol. 135, 369-377 (2014)
Bartel, S. ; Schulz, N. ; Alessandrini, F. ; Theis, F.J. ; Eickelberg, O. ; Kicic, A. ; Freishtat, R.J. ; Krauss-Etschmann, S.
Allergy 69, 40-41 (2014)
Winkler, C. ; Krumsiek, J. ; Buettner, F. ; Angermüller, C. ; Giannopoulou, E.Z. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G. ; Bonifacio, E.
Diabetologia 57, 2521-2529 (2014)
Matthes, M. ; Preusse, M. ; Zhang, J. ; Schechter, J. ; Mayer, D. ; Lentes, B. ; Theis, F.J. ; Prakash, N. ; Wurst, W. ; Trümbach, D.
Database 2014:bau083 (2014)
Thalheimer, F.B. ; Wingert, S. ; de Giacomo, P. ; Haetscher, N. ; Brill, B. ; Theis, F.J. ; Hennighausen, L. ; Schroeder, T. ; Rieger, M.
Exp. Hematol. 42, S57 (2014)
Moignard, V. ; Woodhouse, S. ; Haghverdi, L. ; Lilly, J. ; Tanaka, Y. ; Wilkinson, A. ; Buettner, F. ; Nishikawa, S. ; Piterman, N. ; Kouskoff, V. ; Theis, F.J. ; Fisher, J. ; Göttgens, B.
Exp. Hematol. 42, S52 (2014)
Vinnikov, I.A. ; Hajdukiewicz, K. ; Reymann, J. ; Beneke, J. ; Czajkowski, R. ; Roth, L.C. ; Novak, M. ; Roller, A. ; Dörner, N. ; Starkuviene, V. ; Theis, F.J. ; Erfle, H. ; Schütz, G. ; Grinevich, V. ; Konopka, W.
J. Neurosci. 34, 10659-10674 (2014)
Garzorz-Stark, N. ; Knapp, B. ; Quaranta, M. ; Mattii, M. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Br. J. Dermatol. 170, E19 (2014)
Quaranta, M. ; Eyerich, S. ; Knapp, B. ; Nasorri, F. ; Scarponi, C. ; Mattii, M. ; Garzorz-Stark, N. ; Harlfinger, A.T. ; Jaeger, T. ; Grosber, M. ; Pennino, D. ; Mempel, M. ; Schnopp, C. ; Theis, F.J. ; Albanesi, C. ; Cavani, A. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Ring, J. ; Eyerich, K.
PLoS ONE 9:e101814 (2014)
Quaranta, M. ; Knapp, B. ; Garzorz-Stark, N. ; Mattii, M. ; Pullabhatla, V. ; Pennino, D. ; Andres, C. ; Traidl-Hoffmann, C. ; Cavani, A. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Sci. Transl. Med. 6:244ra90 (2014)
Garzorz, N.V. ; Quaranta, M. ; Knapp, B. ; Mattii, M. ; Andres, C. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
J. Invest. Dermatol. 134, S1 (2014)
Hasenauer, J. ; Hasenauer, C. ; Hucho, T. ; Theis, F.J.
PLoS Comput. Biol. 10:e1003686 (2014)
Thalheimer, F.B. ; Wingert, S. ; de Giacomo, P. ; Haetscher, N. ; Rehage, M. ; Brill, B. ; Theis, F.J. ; Hennighausen, L. ; Schroeder, T. ; Rieger, M.A.
Stem Cell Rep. 3, 34-43 (2014)
Ried, J.S. ; Shin, S.Y. ; Krumsiek, J. ; Illig, T. ; Theis, F.J. ; Spector, T.D. ; Adamski, J. ; Wichmann, H.-E. ; Strauch, K. ; Soranzo, N. ; Suhre, K. ; Gieger, C.
Hum. Mol. Genet. 23, 5847-5857 (2014)
Meyer, S.U. ; Stoecker, K. ; Sass, S. ; Theis, F.J. ; Pfaffl, M.W.
Methods Mol. Biol. 1160, 165-188 (2014)
Shin, S.Y. ; Fauman, E.B. ; Petersen, A.-K. ; Krumsiek, J. ; Santos, R. ; Huang, J. ; Arnold, M. ; Erte, I. ; Forgetta, V. ; Yang, T.P. ; Walter, K. ; Menni, C. ; Chen, L. ; Vasquez, L. ; Valdes, A.M. ; Hyde, C.L. ; Wang, V. ; Ziemek, D. ; Roberts, P. ; Xi, L. ; Grundberg, E. ; Waldenberger, M. ; Richards, J.B. ; Mohney, R.P. ; Milburn, M.V. ; John, S.L. ; Trimmer, J. ; Theis, F.J. ; Overington, J.P. ; Suhre, K. ; Brosnan, M.J. ; Gieger, C. ; Kastenmüller, G. ; Spector, T.D. ; Soranzo, N.
Nat. Genet. 46, 543-550 (2014)
Quaranta, M. ; Knapp, B. ; Theis, F.J. ; Ring, J. ; Schmidt-Weber, C.B. ; Eyerich, S. ; Eyerich, K.
Exp. Dermatol. 23, E20 (2014)
Buettner, F. ; Moignard, V. ; Göttgens, B. ; Theis, F.J.
Bioinformatics 30, 1867-1875 (2014)
Baumann, S. ; Rockstroh, M. ; Bartel, J. ; Krumsiek, J. ; Otto, W. ; Jungnickel, H. ; Potratz, S. ; Luch, A. ; Wilscher, E. ; Theis, F.J. ; von Bergen, M. ; Tomm, J.M.
J. Integr. OMICS, DOI: 10.5584/jiomics.v4i1.157 (2014)
Yang, D. ; Lutter, D. ; Burtscher, I. ; Uetzmann, L. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.
Development 141, 514-525 (2014)
Bajikar, S.S. ; Fuchs, C. ; Roller, A. ; Theis, F.J. ; Janes, K.A.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111, E626-E635 (2014)
Bonifacio, E. ; Krumsiek, J. ; Winkler, C. ; Theis, F.J. ; Ziegler, A.-G.
Acta Diabetol. 51, 403-411 (2014)
Albrecht, E. ; Waldenberger, M. ; Krumsiek, J. ; Evans, A.M. ; Jeratsch, U. ; Breier, M. ; Adamski, J. ; Koenig, W. ; Zeilinger, S. ; Fuchs, C. ; Klopp, N. ; Theis, F.J. ; Wichmann, H.-E. ; Suhre, K. ; Illig, T. ; Strauch, K. ; Peters, A. ; Gieger, C. ; Kastenmüller, G. ; Döring, A. ; Meisinger, C.
Metabolomics 10, 141-151 (2014)
2013
Kong, B. ; Wu, W. ; Cheng, T. ; Schlitter, A.M. ; Bruns, P. ; Jaeger, C. ; Regel, I. ; Raulefs, S. ; Behler, N. ; Irmler, M. ; Beckers, J. ; Erkan, M. ; Theis, F.J. ; Esposito, I. ; Kleeff, J. ; Michalski, C.W.
Pancreas 42, 1360-1361 (2013)
Kong, B. ; Behler, N. ; Bruns, P. ; Schlitter, A.M. ; Valkovska, N. ; Fritzsche, S. ; Raulefs, S. ; Regel, I. ; Erkan, M. ; Theis, F.J. ; Esposito, I. ; Kleeff, J. ; Michalski, C.W.
Pancreas 42, 1360 (2013)
Kuruoglu, E.E. ; Theis, F.J.
EURASIP J. Adv. Signal Process. 2013:185 (2013)
Vehlow, C. ; Hasenauer, J. ; Krämer, A. ; Raue, A. ; Hug, S. ; Timmer, J. ; Radde, N. ; Theis, F.J. ; Weiskopf, D.
BMC Bioinformatics 14:S2 (2013)
Bartel, S. ; Schulz, N. ; Theis, F.J. ; Alessandrini, F. ; Takenaka, S. ; Eickelberg, O. ; Krauss-Etschmann, S.
Allergy 68, 233-233 (2013)
Bartel, J. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J.
Comp. Struc. Biotech. J. 4:e201301009 (2013)
Kazeroonian, A. ; Hasenauer, J. ; Theis, F.J.
In: Autio, R.* ; Shmulevich, I.* ; Strimmer, K.* ; Wiuf, C.* ; Sarbu, S.* ; Yli-Harja, O.* [Eds.]: Proceedings of the WCSB 2013 (10th International Workshop on Computational Systems Biology, 10 - 12 June 2013, Tampere, Finland). Tampere: Tampere International Center for Signal Processing, 2013. 66-73 (TICSP Series ; 63)
Sass, S. ; Buettner, F. ; Müller, N.S. ; Theis, F.J.
Nucleic Acids Res. 41, 9622-9633 (2013)
Buggenthin, F. ; Marr, C. ; Schwarzfischer, M. ; Hoppe, P.S. ; Hilsenbeck, O. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
BMC Bioinformatics 14:297 (2013)
Raue, A. ; Schilling, M. ; Bachmann, J. ; Matteson, A. ; Schelker, M. ; Kaschek, D. ; Hug, S. ; Kreutz, C. ; Harms, B.D. ; Theis, F.J. ; Klingmüller, U. ; Timmer, J.
PLoS ONE 8:e74335 (2013)
Bartel, S. ; Schulz, N. ; Theis, F.J. ; Alessandrini, F. ; Takenaka, S. ; Eickelberg, O. ; Krauss-Etschmann, S.
Eur. Respir. J. 42 (2013)
Andres, C. ; Hasenauer, J. ; Ahn, H.S. ; Joseph, E.K. ; Isensee, J. ; Theis, F.J. ; Allgöwer, F. ; Levine, J.D. ; Dib-Hajj, S.D. ; Waxman, S.G. ; Hucho, T.
Pain 154, 2216-2226 (2013)
Rinck, A. ; Preusse, M. ; Laggerbauer, B. ; Lickert, H. ; Engelhardt, S. ; Theis, F.J.
RNA Biol. 10, 1125-1135 (2013)
Hock, S. ; Ng, Y.K. ; Hasenauer, J. ; Wittmann, D.M. ; Lutter, D. ; Trümbach, D. ; Wurst, W. ; Prakash, N. ; Theis, F.J.
BMC Syst. Biol. 7:48 (2013)
Hug, S. ; Raue, A. ; Hasenauer, J. ; Bachmann, J. ; Klingmüller, U. ; Timmer, J. ; Theis, F.J.
Math. Biosci. 246, 293-304 (2013)
Schmidl, D. ; Czado, C. ; Hug, S. ; Theis, F.J.
Bayesian Anal. 8, 1-22 (2013)
Schmidl, D. ; Czado, C. ; Hug, S. ; Theis, F.J.
Bayesian Anal. 8, 33-42 (2013)
Wittmann, D.M. ; Hock, S. ; Theis, F.J.
SIAM J. Appl. Dyn. Syst. 12, 315-351 (2013)
Rickert, D. ; Fricker, N. ; Lavrik, I.N. ; Theis, F.J.
In: Lavrik, I.N.* [Eds.]: Systems Biology of Apoptosis. New York: Springer, 2013. 57-84
Moignard, V. ; Macaulay, I.C. ; Swiers, G. ; Buettner, F. ; Schütte, J. ; Calero-Nieto, F.J. ; Kinston, S. ; Joshi, A. ; Hannah, R. ; Theis, F.J. ; Jacobsen, S.E. ; de Bruijn, M.F. ; Göttgens, B.
Nat. Cell Biol. 15, 363-372 (2013)
Bardehle, S. ; Krüger, M. ; Buggenthin, F. ; Schwausch, J. ; Ninkovic, J. ; Clevers, H. ; Snippert, H.J. ; Theis, F.J. ; Meyer-Luehmann, M. ; Bechmann, I. ; Dimou, L. ; Götz, M.
Nat. Neurosci. 16, 580-586 (2013)
Vehlow, C. ; Hasenauer, J. ; Theis, F.J. ; Weiskopf, D.
In: Proceedings of the 6th IEEE Pacific Visualization Symposium (IEEE PacificVis 2013 : 27.02.-01.03.2013, Sydney, Australia). Sydney, Australia: Univ. Sydney, 2013. 201-208
Ried, J.S. ; Baurecht, H. ; Stückler, F. ; Krumsiek, J. ; Gieger, C. ; Heinrich, J. ; Kabesch, M. ; Prehn, C. ; Peters, A. ; Rodriguez, E. ; Schulz, H. ; Strauch, K. ; Suhre, K. ; Wang-Sattler, R. ; Wichmann, H.-E. ; Theis, F.J. ; Illig, T. ; Adamski, J. ; Weidinger, S.
Allergy 68, 629-636 (2013)
Xu, T. ; Holzapfel, C. ; Dong, X. ; Bader, E. ; Yu, Z. ; Prehn, C. ; Perstorfer, K. ; Jaremek, M. ; Römisch-Margl, W. ; Rathmann, W. ; Li, Y. ; Wichmann, H.-E. ; Wallaschofski, H. ; Ladwig, K.-H. ; Theis, F.J. ; Suhre, K. ; Adamski, J. ; Illig, T. ; Peters, A. ; Wang-Sattler, R.
BMC Med. 11:60 (2013)
Köttgen, A. ; Albrecht, E. ; Teumer, A. ; Vitart, V. ; Krumsiek, J. ; Hundertmark, C. ; Pistis, G. ; Ruggiero, D. ; O'Seaghdha, C.M. ; Haller, T. ; Yang, Q. ; Tanaka, T. ; Johnson, A.D. ; Kutalik, Z. ; Smith, A.V. ; Shi, J. ; Struchalin, M. ; Middelberg, R.P. ; Brown, M.J. ; Gaffo, A.L. ; Pirastu, N. ; Li, G. ; Hayward, C. ; Zemunik, T. ; Huffman, J. ; Yengo, L. ; Zhao, J.H. ; Demirkan, A. ; Feitosa, M.F. ; Liu, X. ; Malerba, G. ; Lopez, L.M. ; van der Harst, P. ; Li, X. ; Kleber, M.E. ; Hicks, A.A. ; Nolte, I.M. ; Johansson, A. ; Murgia, F. ; Wild, S.H. ; Bakker, S.J. ; Peden, J.F. ; Dehghan, A. ; Steri, M. ; Tenesa, A. ; Lagou, V. ; Salo, P. ; Mangino, M. ; Rose, L.M. ; Lehtimäki, T. ; Woodward, O.M. ; Okada, Y. ; Tin, A. ; Müller, C. ; Oldmeadow, C. ; Putku, M. ; Czamara, D. ; Kraft, P. ; Frogheri, L. ; Thun, G.A. ; Grotevendt, A. ; Gislason, G.K. ; Harris, T.B. ; Launer, L.J. ; McArdle, P. ; Shuldiner, A.R. ; Boerwinkle, E. ; Coresh, J. ; Schmidt, H. ; Schallert, M. ; Martin, N.G. ; Montgomery, G.W. ; Kubo, M. ; Nakamura, Y. ; Munroe, P.B. ; Samani, N.J. ; Jacobs, D.R. J.r. ; Liu, K. ; D'Adamo, P. ; Ulivi, S. ; Rotter, J.I. ; Psaty, B.M. ; Vollenweider, P. ; Waeber, G. ; Campbell, S. ; Devuyst, O. ; Navarro, P. ; Kolcic, I. ; Hastie, N. ; Balkau, B. ; Froguel, P. ; Esko, T. ; Salumets, A. ; Khaw, K.T. ; Langenberg, C. ; Wareham, N.J. ; Isaacs, A. ; Kraja, A. ; Zhang, Q. ; Wild, P.S. ; Scott, R.J. ; Holliday, E.G. ; Org, E. ; Viigimaa, M. ; Bandinelli, S. ; Metter, J.E. ; Lupo, A. ; Trabetti, E. ; Sorice, R. ; Döring, A. ; Lattka, E. ; Strauch, K. ; Theis, F.J. ; Waldenberger, M. ; Wichmann, H.-E. ; Davies, G. ; Gow, A.J. ; Bruinenberg, M. ; LifeLines Cohort Study ; Stolk, R.P. ; Kooner, J.S. ; Zhang, W. ; Winkelmann, B.R. ; Boehm, B.O. ; Lucae, S. ; Penninx, B.W. ; Smit, J.H. ; Curhan, G. ; Mudgal, P. ; Plenge, R.M. ; Portas, L. ; Persico, I. ; Kirin, M. ; Wilson, J.F. ; Leach, I.M. ; van Gilst, W.H. ; Goel, A. ; Ongen, H. ; Hofman, A. ; Rivadeneira, F. ; Uitterlinden, A.G. ; Imboden, M. ; von Eckardstein, A. ; Cucca, F. ; Nagaraja, R. ; Piras, M.G. ; Nauck, M. ; Schurmann, C. ; Budde, K. ; Ernst, F. ; Farrington, S.M. ; Theodoratou, E. ; Prokopenko, I. ; Stumvoll, M. ; Jula, A. ; Perola, M. ; Salomaa, V. ; Shin, S.Y. ; Spector, T.D. ; Sala, C. ; Ridker, P.M. ; Kähönen, M. ; Viikari, J. ; Hengstenberg, C. ; Nelson, C.P. ; Gieger, C. ; CARDIoGRAM Consortium (Wichmann, H.-E. ; Illig, T. ; Döring, A. ; Meisinger, C. ; Klopp, N. ; Peters, A. ; Meitinger, T.) ; DIAGRAM Consortium (Huth, C. ; Thorand, B. ; Meitinger, T. ; Gieger, C. ; Klopp, N. ; Grallert, H. ; Wichmann, H.-E. ; Illig, T. ; Petersen, A.-K.) ; ICBP Consortium ; MAGIC Investigators (Wichmann, H.-E. ; Illig, T. ; Meisinger, C. ; Gieger, C. ; Thorand, B. ; Grallert, H.) ; Meschia, J.F. ; Nalls, M.A. ; Sharma, P. ; Singleton, A.B. ; Kamatani, N. ; Zeller, T. ; Burnier, M. ; Attia, J. ; Laan, M. ; Klopp, N. ; Hillege, H.L. ; Kloiber, S. ; Choi, H. ; Pirastu, M. ; Tore, S. ; Probst-Hensch, N.M. ; Völzke, H. ; Gudnason, V. ; Parsa, A. ; Schmidt, R. ; Whitfield, J.B. ; Fornage, M. ; Gasparini, P. ; Siscovick, D.S. ; Polasek, O. ; Campbell, H. ; Rudan, I. ; Bouatia-Naji, N. ; Metspalu, A. ; Loos, R.J. ; van Duijn, C.M. ; Borecki, I.B. ; Ferrucci, L. ; Gambaro, G. ; Deary, I.J. ; Wolffenbuttel, B.H. ; Chambers, J.C. ; Marz, W. ; Pramstaller, P.P. ; Snieder, H. ; Gyllensten, U. ; Wright, A.F. ; Navis, G. ; Watkins, H. ; Witteman, J.C. ; Sanna, S. ; Schipf, S. ; Dunlop, M.G. ; Tönjes, A. ; Ripatti, S. ; Soranzo, N. ; Toniolo, D. ; Chasman, D.I. ; Raitakari, O. ; Kao, W.H. ; Ciullo, M. ; Fox, C.S. ; Caulfield, M. ; Bochud, M.
Nat. Genet. 45, 145-154 (2013)
Altmaier, E. ; Emeny, R.T. ; Krumsiek, J. ; Lacruz, M.E. ; Lukaschek, K. ; Häfner, S. ; Kastenmüller, G. ; Römisch-Margl, W. ; Prehn, C. ; Mohney, R.P. ; Evans, A.M. ; Milburn, M.V. ; Illig, T. ; Adamski, J. ; Theis, F.J. ; Suhre, K. ; Ladwig, K.-H.
Psychoneuroendocrinology 38, 1299-1309 (2013)
Raue, A. ; Kreutz, C. ; Theis, F.J. ; Timmer, J.
Philos. Trans. R. Soc. A - Math. Phys. Eng. Sci. 371:20110544 (2013)
2012
Cichocki, A. ; Theis, F.J. ; Yeredor, A. ; Zibulevsky, M.
Lecture Notes Comp. Sci. 7191, V-VII (2012)
Gutch, H.W. ; Gruber, P. ; Yeredor, A. ; Theis, F.J.
Signal Process. 92, 1796-1808 (2012)
Ruepp, A. ; Kowarsch, A. ; Theis, F.J.
Methods Mol. Biol. 822, 249-260 (2012)
Theis, F.J. ; Cichocki, A.* ; Yeredor, A.* ; Zibulevsky, M.*[Eds.]
Berlin [u.a.]: Springer, 2012. ( ; 7191)
Nordhausen, K. ; Gutch, H.W. ; Oja, H. ; Theis, F.J.
In: Theis, F.J. ; Cichocki, A.* ; Yeredor, A* ; Zibulevsky, M.* [Eds.]: Proceedings (10th international conference on Latent Variable Analysis and Signal Separation). Heidelberg: Springer, 2012. 172-179 (Lecture Notes in Computer Science ; 7191)
Chursov, A. ; Kopetzky, S.J. ; Leshchiner, I. ; Kondofersky, I. ; Theis, F.J. ; Frishman, D. ; Shneider, A.
RNA Biol. 9, 1266-1274 (2012)
Gutch, H.W. ; Theis, F.J.
In: Theis, F.J. ; Cichocki, A.* ; Yeredor, A* ; Zibulevsky, M.* [Eds.]: Proceedings (10th International Conference, LVA/ICA 2012, 12-15 March 2012, Tel Aviv, Israel). Heidelberg: Springer, 2012. 180-187 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 7191)
Plant, C.C. ; Mai Thai, S. ; Shao, J. ; Theis, F.J. ; Meyer-Bäse, A. ; Böhm, C.
Adv. Artif. Neural Syst. 2012:962105 (2012)
Krumsiek, J. ; Stückler, F. ; Kastenmüller, G. ; Theis, F.J.
In: Suhre, K.* [Eds.]: Genetics Meets Metabolomics: from Experiment to Systems Biology. New York: Springer, 2012. 281-313
Winkler, C. ; Krumsiek, J. ; Lempainen, J. ; Achenbach, P. ; Grallert, H. ; Giannopoulou, E.Z. ; Bunk, M. ; Theis, F.J. ; Bonifacio, E. ; Ziegler, A.-G.
Genes Immun. 13, 549-555 (2012)
Krumsiek, J. ; Suhre, K. ; Evans, A.M. ; Mitchell, M.W. ; Mohney, R.P. ; Milburn, M.V. ; Wägele, B. ; Römisch-Margl, W. ; Illig, T. ; Adamski, J. ; Gieger, C. ; Theis, F.J. ; Kastenmüller, G.
PLoS Genet. 8:e1003005 (2012)
Theis, F.J.
In: Theis, F.J. ; Cichocki, A.* ; Yeredor, A* ; Zibulevsky, M.* [Eds.]: Proceedings (10th international conference on Latent Variable Analysis and Signal Separation). Heidelberg: Springer, 2012. 528-535 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 7191)
Hug, S. ; Theis, F.J.
In: Theis, F.J. ; Cichocki, A.* ; Yeredor, A* ; Zibulevsky, M.* [Eds.]: Proceedings (10th international conference on Latent Variable Analysis and Signal Separation). Heidelberg: Springer, 2012. 520-527 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 7191)
Illner, K. ; Fuchs, C. ; Theis, F.J.
In: Larjo, A.* ; Schober, S.* ; Farhan, M.* ; Bossert, M.* ; Yli-Harja, O.* [Eds.]: Proceedings (Ninth International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2012, June 4-6, 2012, Ulm, Germany). Tampere, Finnland: Tampere International Center for Signal Processing, 2012. 43-46 (Proc. WCSB ; 61)
Gutch, H.W. ; Theis, F.J.
J. Multivar. Anal. 112, 48-62 (2012)
Marr, C. ; Strasser, M. ; Schwarzfischer, M. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
FEBS J. 279, 3488-3500 (2012)
Petersen, A.-K. ; Krumsiek, J. ; Wägele, B. ; Theis, F.J. ; Wichmann, H.-E. ; Gieger, C. ; Suhre, K.
BMC Bioinformatics 13:120 (2012)
Schmidl, D. ; Hug, S. ; Li, W.B. ; Greiter, M. ; Theis, F.J.
BMC Syst. Biol. 6:95 (2012)
Sterz, K. ; Scherer, G. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Ecker, J.
Chem. Res. Toxicol. 25, 1565-1567 (2012)
Peng, C. ; Li, N. ; Ng, Y.K. ; Zhang, J. ; Meier, F. ; Theis, F.J. ; Merkenschlager, M. ; Chen, W. ; Wurst, W. ; Prakash, N.
J. Neurosci. 32, 13292-13308 (2012)
Krumsiek, J. ; Suhre, K. ; Illig, T. ; Adamski, J. ; Theis, F.J.
J. Proteome Res. 11, 4120-4131 (2012)
Jourdan, C. ; Petersen, A.-K. ; Gieger, C. ; Döring, A. ; Illig, T. ; Wang-Sattler, R. ; Meisinger, C. ; Peters, A. ; Adamski, J. ; Prehn, C. ; Suhre, K. ; Altmaier, E. ; Kastenmüller, G. ; Römisch-Margl, W. ; Theis, F.J. ; Krumsiek, J. ; Wichmann, H.-E. ; Linseisen, J.
PLoS ONE 7:e40009 (2012)
Konrad, M. ; Vyleta, M.L. ; Theis, F.J. ; Stock, M. ; Tragust, S. ; Klatt, M. ; Drescher, V. ; Marr, C. ; Ugelvig, L.V. ; Cremer, S.
PLoS Biol. 10:e1001300 (2012)
Krug, S. ; Kastenmüller, G. ; Stückler, F. ; Rist, M.J. ; Skurk, T. ; Sailer, M. ; Raffler, J. ; Römisch-Margl, W. ; Adamski, J. ; Prehn, C. ; Frank, T. ; Engel, K.-H. ; Hofmann, T. ; Luy, B. ; Zimmermann, R. ; Moritz, F. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Krumsiek, J. ; Kremer, W. ; Huber, F. ; Oeh, U. ; Theis, F.J. ; Szymczak, W. ; Hauner, H. ; Suhre, K. ; Daniel, H.
FASEB J. 26, 2607-2619 (2012)
Meyer-Bäse, A. ; Cappendijk, S. ; Theis, F.J.
In: Arabnia, H.R.* ; Tran, Q.-N.* [Eds.]: Proceedings (2011 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology (BIOCOMP '11), 18-21 July 2011, Las Vegas, USA). Athens, GA, USA: CSREA Press, 2012. 751-759
Lutter, D. ; Bruns, P. ; Theis, F.J.
In: Goryanin, I.I.* ; Goryachev, A.B.* [Eds.]: Advances in Systems Biology. New York: Springer, 2012. 247-260 (Adv. Exp. Med. Biol. ; 736)
Grady, D. ; Brune, R. ; Thiemann, C. ; Theis, F.J. ; Brockmann, D.
In: Thai, M.T.* ; Pardalos, P.M.* [Eds.]: Handbook of Optimization in Complex Networks. Theory and Applications. New York, NJ: Springer, 2012. 169-208 (Optimization and Its Applications ; 57)
Burtscher, I. ; Barkey, W. ; Schwarzfischer, M. ; Theis, F.J. ; Lickert, H.
Genesis 50, 496-505 (2012)
2011
Vincent, E. ; Araki, S. ; Theis, F.J. ; Nolte, G. ; Bofill, P. ; Sawada, H. ; Ozerov, A. ; Gowreesunker, V. ; Lutter, D. ; Duong, N.Q.K.
Signal Process. 92, 1928-1936 (2011)
Meyer-Bäse, A. ; Plant, C. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Emmett, M. ; Conrad, C.A.
In: Arabnia, H.R.* ; Tran, Q.-N.* [Eds.]: Proceedings (The 2011 International Conference on Bioinformatics and Computational Biology). Elsevier, 2011. ( ; Proceedings of BIOCOMP'11)
Lang, E.W. ; Schachtner, R. ; Lutter, D. ; Herold, D. ; Kodewitz, A. ; Blöchl, F. ; Theis, F.J. ; Keck, I.R. ; Górriz Sáez, J.M. ; Gomez, P. ; Gómez Vilda, P. ; Tomé, A.M.
In: Górriz, J.M.* ; Lang, E.W.* ; Ramirez, J.* [Eds.]: Recent Advances in Biomedical Signal Processing. Sharjah: Bentham Science, 2011. 26-47
Theis, F.J. ; Kawanabe, M. ; Müller, K.-R.
IEEE Trans. Signal Process. 59, 4478 - 4482 (2011)
Breindl, C. ; Waldherr, S. ; Wittmann, D.M. ; Theis, F.J. ; Allgoewer, F.
Int. J. Robust Nonlin. 21, 1742-1758 (2011)
Müller, N.S. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J. ; Böhm, C. ; Meyer-Bäse, A.
Proc. SPIE 8058:805819 (2011)
Schwarzfischer, M. ; Marr, C. ; Krumsiek, J. ; Hoppe, P.S. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
In: Proceedings (Microscopic Image Analysis with Applications in Biology, 2nd September 2011, Heidelberg, Germany). Heidelberg: MIAAB, 2011. http://www.miaab.org/miaab-2011-
Blöchl, F. ; Theis, F.J. ; Vega-Redondo, F. ; Fisher, E.
Phys. Rev. E 83:046127 (2011)
Krumsiek, J. ; Wittmann, D.M. ; Theis, F.J.
Applications of MATLAB in Science and Engineering. Rijeka: InTech, 2011. 35-60
Kowarsch, A. ; Preusse, M. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
RNA 17, 809-819 (2011)
Theis, F.J. ; Latif, N. ; Wong, P. ; Frishman, D.
Mol. Biol. Evol. 28, 2501-2512 (2011)
Wittmann, D.M. ; Theis, F.J.
New J. Phys. 13:013041 (2011)
Gutch, H.W. ; Krumsiek, J. ; Theis, F.J.
In: Eur. Signal Process. Conf (19th European Signal Processing Conference, 29 August - 2 September 2011, Barcelona). Barcelona: EUSIPCO, 2011. 1733-1737
Sass, S. ; Dietmann, S. ; Burk, U.C. ; Brabletz, S. ; Lutter, D. ; Kowarsch, A. ; Mayer, K.F.X. ; Brabletz, T. ; Ruepp, A. ; Theis, F.J. ; Wang, Y.
BMC Syst. Biol. 5:136 (2011)
Hennig, H. ; Fleischmann, R. ; Fredebohm, A. ; Hagmayer, Y. ; Nagler, J. ; Witt, A. ; Theis, F.J. ; Geisel, T.
PLoS ONE 6:e26457 (2011)
Krumsiek, J. ; Marr, C. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
PLoS ONE 6:e22649 (2011)
Mittelstraß, K. ; Ried, J.S. ; Yu, Z. ; Krumsiek, J. ; Gieger, C. ; Prehn, C. ; Römisch-Margl, W. ; Polonikov, A. ; Peters, A. ; Theis, F.J. ; Meitinger, T. ; Kronenberg, F. ; Weidinger, S. ; Wichmann, H.-E. ; Suhre, K. ; Wang-Sattler, R. ; Adamski, J. ; Illig, T.
PLoS Genet. 7:e1002215 (2011)
Laaser, I. ; Theis, F.J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Kolb, H.-J. ; Adamski, J.
OMICS 15, 141-154 (2011)
Krumsiek, J. ; Suhre, K. ; Illig, T. ; Adamski, J. ; Theis, F.J.
BMC Syst. Biol. 5:21 (2011)
Lang, E.W. ; Schachtner, R. ; Lutter, D. ; Herold, D. ; Kodewitz, A. ; Blöchl, F. ; Theis, F.J. ; Keck, I.R. ; Górriz Sáez, J.M. ; Gómez Vilda, P. ; Tomé, A.M.
In: Górriz, J.M.* ; Lang, E.W.* ; Ramirez, J.* [Eds.]: Recent Advances in Biomedical Signal Processing. Oak Park, IL: Bentham Science Publishers, 2011. 26-47
Raia, V. ; Schilling, M. ; Böhm, M. ; Hahn, B. ; Kowarsch, A. ; Raue, A. ; Sticht, C. ; Bohl, S. ; Saile, M. ; Möller, P. ; Gretz, N. ; Timmer, J. ; Theis, F.J. ; Lehmann, W.D. ; Lichtner, P. ; Klingmüller, U.
Cancer Res. 71, 693-704 (2011)
Theis, F.J. ; Bohl, S. ; Klingmüller, U.
Bull. Math. Biol. 73, 978-1003 (2011)
Baskaran, T. ; Blöchl, F. ; Brück, T. ; Theis, F.J.
Int. Rev. Econom. Finance 20, 135-145 (2011)
Blöchl, F. ; Wittmann, D.M. ; Theis, F.J.
Bull. Math. Biol. 73, 706-725 (2011)
Blöchl, F. ; Rascle, A. ; Kastner, J. ; Witzgall, R. ; Lang, E.W. ; Theis, F.J.
In: Górriz, J.M.* ; Lang, E.W.* ; Ramirez, J.* [Eds.]: Recent Advances in Biomedical Signal Processing. Hilversum: Bentham Science Publishers, 2011. 157-170
2010
Theis, F.J. ; Meyer-Bäse, A.
In: Biomedical Signal Analysis - Contemporary Methods and Applications. Cambridge, MA: MIT Press, 2010. 1-28
Kowarsch, A. ; Blöchl, F. ; Bohl, S. ; Saile, M. ; Gretz, N. ; Klingmüller, U. ; Theis, F.J.
BMC Bioinformatics 11:585 (2010)
Wittmann, D.M. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
J. Theor. Biol. 266, 436-448 (2010)
Krumsiek, J. ; Pölsterl, S. ; Wittmann, D.M. ; Theis, F.J.
BMC Bioinformatics 11, 1-10:233 (2010)
Gutch, H.W. ; Maehara, T. ; Theis, F.J.
In: Vigneron, V.* ; Zarzoso, V.* ; Moreau, E.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Berlin: Springer, 2010. 370-377 ( ; 6365)
Thiemann, C. ; Theis, F.J. ; Grady, D. ; Brune, R. ; Brockmann, D.
PLoS ONE 5:e15422 (2010)
Araki, S. ; Ozerov, A. ; Gowreesunker, V. ; Sawada, H. ; Theis, F.J. ; Nolte, G. ; Lutter, D. ; Duong, N.Q.K.
In: Vigneron, V.* ; Zarzoso, V.* ; Moreau, E.* [Eds.]: Latent variable analysis and signal separation (Latent variable analysis and signal separation 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Berlin: Springer, 2010. 114-122 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 6365)
Araki, S. ; Theis, F.J. ; Nolte, G. ; Lutter, D. ; Ozerov, A. ; Gowreesunker, V. ; Sawada, H. ; Duong, N.Q.K.
In: Vigneron, V.* ; Zarzoso, V.* ; Moreau, E.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Berlin: Springer, 2010. 123-130 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 6365)
Gutch, H.W. ; Gruber, P. ; Theis, F.J.
In: Vigneron, V.* ; Zarzoso, V.* ; Moreau, E.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Berlin: Springer, 2010. 645-652 ( ; 6365)
Blöchl, F. ; Kowarsch, A. ; Theis, F.J.
In: Vigneron, V.* ; Zarzoso, V.* ; Moreau, E.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Berlin: Springer, 2010. 434-441 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 6365)
Mewes, H.-W. ; Ruepp, A. ; Theis, F.J. ; Rattei, T. ; Walter, M.C. ; Frishman, D. ; Suhre, K. ; Spannagl, M. ; Mayer, K.F.X. ; Stuempflen, V. ; Antonov, A.
Nucleic Acids Res. 39, 1, D220-D224 (2010)
Theis, F.J. ; Müller, N.S. ; Plant, C. ; Böhm, C.
In: Vigneron, V.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Heidelberg: Springer, 2010. 466-473 (LNCS; 6365)
Theis, F.J.
IEEE Trans. Circuits Syst. I-Regul. Pap. 57, 1463-1474 (2010)
Hartsperger, M.L. ; Blöchl, F. ; Stuempflen, V. ; Theis, F.J.
BMC Bioinformatics 11:522 (2010)
Kowarsch, A. ; Marr, C. ; Schmidl, D. ; Ruepp, A. ; Theis, F.J.
PLoS ONE 5:e11154 (2010)
Blöchl, F. ; Hartsperger, M.L. ; Stuempflen, V. ; Theis, F.J.
In: Schomburg, D.* ; Grote, A.* [Eds.]: Proceedings (German Conference on Bioinformatics 2010). Bonn: Ges. f. Inform., 2010. 31-40 ( ; P-173)
Ruepp, A. ; Kowarsch, A. ; Schmidl, D. ; Buggenthin, F. ; Brauner, B. ; Dunger, I. ; Fobo, G. ; Frishman, G. ; Montrone, C. ; Theis, F.J.
Genome Biol. 11:R6 (2010)
Konopka, W. ; Kiryk, A. ; Novak, M. ; Herwerth, M. ; Parkitna, J.R. ; Wawrzyniak, M. ; Kowarsch, A. ; Michaluk, P. ; Dzwonek, J. ; Arnsperger, T. ; Wilczynski, G. ; Merkenschlager, M. ; Theis, F.J. ; Köhr, G. ; Kaczmarek, L. ; Schütz, G.
J. Neurosci. 30, 14835-14842 (2010)
Plant, C. ; Theis, F.J. ; Meyer-Bäse, A. ; Böhm, C.
In: Vigneron, V.* ; Zarzoso, V.* ; Moreau, E.* [Eds.]: Proceedings (Latent variable analysis and signal separation : 9th international conference, 27-30 September 2010, St. Malo, France). Berlin: Springer, 2010. 254-262 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 6365)
Blöchl, F. ; Theis, F.J. ; Vega-Redondo, F. ; Fisher, E.O'N.
In: Empirical and theoretical methods. München: ifo Institut für Wirtschaftsforschung e.V., 2010. 1-20 (CESifo working paper series ; 3175)
Meyer-Bäse, A. ; Plant, C. ; Cappendijk, S. ; Theis, F.J.
In: Proceedings (BIOCOMP'10 - The 2010 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology). Las Vegas (Nevada): CSREA Press, 2010.
Lutter, D. ; Marr, C. ; Krumsiek, J. ; Lang, E.W. ; Theis, F.J.
BMC Genomics 11:224 (2010)
Kreuzpointner, L. ; Simon, P. ; Theis, F.J.
Br. J. Math. Stat. Psychol. 63, 341-360 (2010)
Theis, F.J. ; Meyer- Bäse, A.
Cambridge, Mass.: MIT Press, 2010. 432 S.
Marr, C. ; Theis, F.J. ; Liebovitch, L.S. ; Hütt, M.-T.
PLoS Comput. Biol. 6, 31:e1000836 (2010)
Ansorg, M. ; Blöchl, F. ; zu Castell, W. ; Theis, F.J. ; Wittmann, D.M.
Int. J. Biomath. Biostat. 1, 9-21 (2010)
Franke, R. ; Theis, F.J. ; Klamt, S.
J. Integr. Bioinform. 7:151 (2010)
2009
Blöchl, F. ; Theis, F.J.
In: Adali, T.* [Eds.]: Independent Component Analysis and Signal Separation. Berlin: Springer, 2009. 387-394 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 5441)
Theis, F.J. ; Cason, T.P. ; Absil, P.A.
In: Adali, T.* [Eds.]: Independent Component Analysis and Signal Separation. Berlin: Springer, 2009. 354-361 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 5441)
Theis, F.J. ; Neher, R. ; Zeug, A.
In: Adali, T.* [Eds.]: Proceedings (Independent Component Analysis and Signal Separation). Berlin: Springer, 2009. 548-556 (Lecture Notes in Computer Science ; 5441)
Wittmann, D.M. ; Blöchl, F. ; Trümbach, D. ; Wurst, W. ; Prakash, N. ; Theis, F.J.
PLoS Comput. Biol. 5:e1000569 (2009)
Wittmann, D.M. ; Schmidl, D. ; Blöchl, F. ; Theis, F.J.
Theor. Comput. Sci. 410, 3826-3838 (2009)
Klamt, S. ; Haus, U.-U. ; Theis, F.J.
PLoS Comput. Biol. 5:e1000385 (2009)
Neher, R.A. ; Mitkovski, M. ; Kirchhoff, F. ; Neher, E. ; Theis, F.J. ; Zeug, A.
Biophys. J. 96, 3791-3800 (2009)
Wittmann, D.M. ; Krumsiek, J. ; Saez-Rodriguez, J. ; Lauffenburg, D.A. ; Klam, S. ; Theis, F.J.
BMC Syst. Biol. 3, 98:98 (2009)
Gruber, P. ; Gutch, H.W. ; Theis, F.J.
In: Adali, T.* [Eds.]: Independent Component Analysis and Signal Separation. Berlin: Springer, 2009. 259-266 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 5441)
Georgiev, P.G. ; Theis, F.J.
In: Romejin, H.E.* ; Pardalos, P.M.* [Eds.]: Handbook of Optimization in Medicine. New York: Springer, 2009. 1-38 (Springer Optimization and Its Applications ; 26)
Georgiev, P.G. ; Theis, F.J.
In: Pardalos, P.M.* ; Romejin, H.E.* [Eds.]: Handbook of Optimization in Medicine. New York: Springer Science + Business Media B.V., 2009. 253-290
Webb, K.J. ; Norton, W.H.J. ; Trümbach, D. ; Meijer, A.H. ; Ninkovic, J. ; Topp, S. ; Heck, D. ; Marr, C. ; Wurst, W. ; Theis, F.J. ; Spaink, H.P. ; Bally-Cuif, L.
Genome Biol. 10:R81 (2009)
Gruber, P. ; Meyer-Bäse, A. ; Foo, S. ; Theis, F.J.
Eng. Appl. Artif. Intel. 22, 497-504 (2009)
2008
Brockmann, D. ; Theis, F.J.
IEEE Pervasive Comput. 7, 28-35 (2008)
Wong, P. ; Althammer, S. ; Hildebrand, A. ; Kirschner, A. ; Pagel, P. ; Geissler, B. ; Smialowski, P. ; Blöchl, F. ; Oesterheld, M. ; Schmidt, T. ; Strack, N. ; Theis, F.J. ; Ruepp, A. ; Frishman, D.
BMC Genomics 9:629 (2008)
Begemann, M. ; Sargin, D. ; Rossner, M.J. ; Bartels, C. ; Theis, F.J. ; Wichert, S.P. ; Stender, N. ; Fischer, B. ; Sperling, S. ; Stawicki, S. ; Wiedl, A. ; Falkai, P. ; Nave, K.A. ; Ehrenreich, H.
Mol. Med. 14, 546-552 (2008)
Adamcio, B. ; Sargin, D. ; Stradomska, A. ; Medrihan, L. ; Gertler, C. ; Theis, F.J. ; Zhang, M. ; Müller, M. ; Hassouna, I. ; Hannke, K. ; Sperling, S. ; Radyushkin, K. ; El-Kordi, A. ; Schulze, L. ; Ronnenberg, A. ; Wolf, F. ; Brose, N. ; Rhee, J.S. ; Zhang, W. ; Ehrenreich, H.
BMC Biol. 6:37 (2008)
Lutter, D. ; Ugocsai, P. ; Grandl, M. ; Orso, E. ; Theis, F.J. ; Lang, E.W. ; Schmitz, G.
BMC Bioinformatics 9:100 (2008)
Theis, F.J. ; Gruber, P. ; Keck, I.R. ; Lang, E.W.
Neurocomp. 71, 2209-2216 (2008)
Schachtner, R. ; Lutter, D. ; Knollmüller, P. ; Tomé, A.M. ; Theis, F.J. ; Schmitz, G. ; Stetter, M. ; Vilda, P.G. ; Lang, E.W.
Bioinformatics 24, 1688-1697 (2008)
2007
Gutch, H.W. ; Theis, F.J.
Lecture Notes Comp. Sci. 4666, 49-56 (2007)
Kawanabe, M. ; Theis, F.J.
Signal Process. 87, 1890-1903 (2007)
Theis, F.J. ; Kawanabe, M.
Lecture Notes Comp. Sci. 4666, 121-128 (2007)
Theis, F.J. ; Georgiev, P. ; Cichocki, A.
EURASIP J. Adv. Signal Process. 2007:052105 (2007)

* external authors, # joint first authors, ° joint corresponding authors

We use cookies to improve your experience on our Website. We need cookies to continuously improve the services, to enable certain features and when embedding services or content of third parties, such as video player. By using our website, you agree to the use of cookies. We use different types of cookies. You can personalize your cookie settings here:

Show detail settings
Please find more information in our privacy statement.

There you may also change your settings later.