Quantitative Single Cell Dynamics

2020
Fischer, C.A, ; Besora-Casals, L. ; Rolland, S.G. ; Haeussler, S. ; Singh, K. ; Duchen, M. ; Conradt, B. ; Marr, C.
iScience 23:101601 (2020)
Jiang, D. ; Christ, S. ; Correa-Gallegos, D. ; Ramesh, P. ; Kalgudde Gopal, S. ; Wannemacher, J. ; Mayr, C. ; Lupperger, V. ; Yu, Q. ; Ye, H. ; Mück-Häusl, M. ; Rajendran, V. ; Wan, L. ; Liu, J. ; Mirastschijski, U. ; Volz, T. ; Marr, C. ; Schiller, H. B. ; Rinkevich, Y.
Nat. Commun. 11 (2020)
Bheda, P. ; Aguilar-Gomez, D. ; Becker, N.B. ; Becker, J. ; Stavrou, E. ; Kukhtevich, I. ; Höfer, T. ; Maerkl, S. ; Charvin, G. ; Marr, C. ; Kirmizis, A. ; Schneider, R.
Mol. Cell 78, 915-925 (2020)
Matek, C. ; Schwarz, S. ; Spiekermann, K. ; Marr, C.
In: Bildverarbeitung für die Medizin 2020. 2020. 53-54 (Inf. aktuell)
Schuh, L. ; Saint-Antoine, M. ; Sanford, E.M. ; Emert, B.L. ; Singh, A. ; Marr, C. ; Raj, A. ; Goyal, Y.
Cell Syst. 10, 363-378.e12 (2020)
Jiang, D. ; Ramesh, P. ; Christ, S. ; Correa-Gallegos, D. ; Gopal, S.K. ; Yu, Q. ; Lupperger, V. ; Marr, C. ; Rinkevich, Y.
Wound Repair Regen. 28, A16-A16 (2020)
Angerer, P. ; Fischer, D.S. ; Theis, F.J. ; Scialdone, A. ; Marr, C.
Bioinformatics 36, 4291-4295 (2020)
Alabert, C. ; Loos, C. ; Voelker-Albert, M. ; Graziano, S. ; Forné, I. ; Reveron-Gomez, N. ; Schuh, L. ; Hasenauer, J. ; Marr, C. ; Imhof, A. ; Groth, A.
Cell Rep. 30, 1223-1234 (2020)
2019
Peng, T. ; Boxberg, M. ; Weichert, W. ; Navab, N. ; Marr, C.
Lecture Notes Comp. Sci. 11764 LNCS, 676-684 (2019)
Sadafi, A. ; Koehler, N. ; Makhro, A. ; Bogdanova, A. ; Navab, N. ; Marr, C. ; Peng, T.
Lecture Notes Comp. Sci. 11764 LNCS, 685-693 (2019)
Matek, C. ; Schwarz, S. ; Spiekermann, K. ; Marr, C.
Nat. Mach. Intell. 1, 538-544 (2019)
Waibel, D.J.E. ; Tiemann, U. ; Lupperger, V. ; Semb, H. ; Marr, C.
In:. 2019. 184-186 (Lecture Notes Comp. Sci. ; 11729 LNCS)
Schneider, M. ; Wang, L. ; Marr, C.
Lecture Notes Comp. Sci. 11728 LNCS, 673-686 (2019)
Mishra, M. ; Schmitt, S. ; Zischka, H. ; Strasser, M. ; Navab, N. ; Marr, C. ; Peng, T.
Lecture Notes Comp. Sci. 11731 LNCS, 289-298 (2019)
Jiang, D. ; Christ, S. ; Gallegos, D.C. ; Ramesh, P. ; Gopal, S.K. ; Yu, Q. ; Mayr, C. ; Lupperger, V. ; Liu, J. ; Marr, C. ; Schiller, H. B. ; Rinkevich, Y.
Exp. Dermatol. 28, E13-E13 (2019)
Tischler, J. ; Gruhn, W.H. ; Reid, J. ; Allgeyer, E. ; Buettner, F. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Simons, B.D. ; Wernisch, L. ; Surani, M.A.
EMBO J. 38:e99518 (2019)
2018
Backofen, R. ; Costa, F. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Preusse, M. ; Becker, C. ; Saunders, S. ; Palme, K. ; Dovzhenko, O.
In: Lecture Notes in Bioengineerin. 2018. 85-100
Kyncl, M. ; Bast, L. ; Henkel, L. ; Theis, F.J. ; Oostendorp, R.A.J. ; Marr, C. ; Goetze, K.S.
Blood 132 (2018)
Chatzopoulou, E.I. ; Raharja-Liu, P. ; Murschhauser, A. ; Sekhavati, F. ; Buggenthin, F. ; Vollmar, A.M. ; Marr, C. ; Rädler, J.O.
Sci. Rep. 8:18042 (2018)
Bast, L. ; Calzolari, F. ; Strasser, M. ; Hasenauer, J. ; Theis, F.J. ; Ninkovic, J. ; Marr, C.
Cell Rep. 25, 3231-3240.e8 (2018)
Feigelman, J ; Weindl, D. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Hasenauer, J.
In: Lecture Notes in Computer Science (16th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, 12-14 September 2018, Brno; Czech Republic). 2018. 300-306 ( ; 11095 LNBI)
Strasser, M. ; Hoppe, P.S. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J. ; Marr, C.
Nat. Commun. 9:2697 (2018)
Viader Llargues, O. ; Lupperger, V. ; Pola-Morell, L. ; Marr, C. ; López-Schier, H.
eLife 7:e30823 (2018)
Matek, C. ; Marr, C. ; Spiekermann, K.
In: (Workshop on Bildverarbeitung fur die Medizin, 11-13 March 2018, Erlangen). 2018. 10-10
Matek, C. ; Marr, C. ; Spiekermann, K.
Oncol. Res. Treat. 41, 197-197 (2018)
2017
Veerman, F. ; Marr, C. ; Popović, N.
J. Math. Biol., 1-52 (2017)
Lupperger, V. ; Buggenthin, F. ; Chapouton, P. ; Marr, C.
Cytometry A 93A, 314-322 (2017)
Peng, T. ; Thorn, K. ; Schroeder, T. ; Wang, L. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Navab, N.
Nat. Commun. 8:14836 (2017)
Blasi, T. ; Buettner, F. ; Strasser, M. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
Phys. Biol. 14:036001 (2017)
Hilsenbeck, O. ; Schwarzfischer, M. ; Loeffler, D. ; Dimopoulos, S. ; Hastreiter, S. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Bioinformatics 33, 2020-2028 (2017)
Buggenthin, F. ; Buettner, F. ; Hoppe, P.S. ; Endele, M. ; Kroiss, M. ; Strasser, M. ; Schwarzfischer, M. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Hilsenbeck, O. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J. ; Marr, C.
Nat. Methods, DOI: 10.1038/nmeth.4182 (2017)
2016
Feigelman, J. ; Ganscha, S. ; Hastreiter, S. ; Schwarzfischer, M. ; Filipczyk, A. ; Schröder, T. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Claassen, M.
Cell Syst. 3, 480-490 (2016)
Mishra, M. ; Schmitt, S. ; Wang, L. ; Strasser, M. ; Marr, C. ; Navab, N. ; Zischka, H. ; Peng, T.
In: Proceedings (Proceedings / IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 13-16 April 2016, Prague, Czech Republic). IEEE, 2016.
Hilsenbeck, O. ; Schwarzfischer, M. ; Skylaki, S. ; Schauberger, B. ; Hoppe, P.S. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Hastreiter, S. ; Skylaki, E. ; Filipczyk, A. ; Strasser, M. ; Buggenthin, F. ; Feigelman, J. ; Krumsiek, J. ; van den Berg, A.J. ; Endele, M. ; Etzrodt, M. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Nat. Biotechnol. 34, 703-706 (2016)
Hoppe, P.S. ; Schwarzfischer, M. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Hilsenbeck, O. ; Moritz, N. ; Endele, M. ; Filipczyk, A. ; Gambardella, A. ; Ahmed, N. ; Etzrodt, M. ; Coutu, D.L. ; Rieger, M.A. ; Marr, C. ; Strasser, M. ; Schauberger, B. ; Burtscher, I. ; Ermakova, O. ; Bürger, A. ; Lickert, H. ; Nerlov, C. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Nature 535, 299-302 (2016)
Dragoi, D. ; Krattenmacher, A. ; Mishra, V.K. ; Schmidt, J. ; Kloos, U. ; Meixner, L.K. ; Hauck, S.M. ; Buggenthin, F. ; Schwartz, D. ; Marr, C. ; Johnsen, S.A. ; Scheel, C.
Oncotarget 7, 30396-30407 (2016)
Blasi, T. ; Feller, C. ; Feigelman, J. ; Hasenauer, J. ; Imhof, A. ; Theis, F.J. ; Becker, P.B. ; Marr, C.
Cell Syst. 2, 49-58 (2016)
Angerer, P. ; Haghverdi, L. ; Büttner, M. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Buettner, F.
Bioinformatics 32, 1241-1243 (2016)
2015
Wang, L. ; Belagiannis, V. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Yang, G.Z. ; Navab, N.
In: Proceedings (12th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2015, 16-19 April 2015, Brooklyn, United States). 2015. 1304-1307
Loos, C. ; Marr, C. ; Theis, F.J. ; Hasenauer, J.
Lecture Notes Comp. Sci. 9308, 52-63 (2015)
Feigelman, J. ; Popovic, N. ; Marr, C.
J. Coupled Syst. Multiscale Dyn. 3, 164-173 (2015)
Preusse, M. ; Marr, C. ; Saunders, S. ; Maticzka, D. ; Lickert, H. ; Backofen, R. ; Theis, F.J.
RNA Biol. 12, 998-1009 (2015)
Filipczyk, A. ; Marr, C. ; Hastreiter, S. ; Feigelman, J. ; Schwarzfischer, M. ; Hoppe, P.S. ; Loeffler, D. ; Kokkaliaris, K.D. ; Endele, M. ; Schauberger, B. ; Hilsenbeck, O. ; Skylaki, S. ; Hasenauer, J. ; Anastassiadis, K. ; Theis, F.J. ; Schroeder, T.
Nat. Cell Biol. 17, 1235-1246 (2015)
Strasser, M. ; Feigelman, J. ; Theis, F.J. ; Marr, C.
BMC Syst. Biol. 9:61 (2015)
Theis, F.J. ; Ugelvig, L.V. ; Marr, C. ; Cremer, S.
Philos. Trans. R. Soc. B - Biol. Sci. 370, DOI: 10.1098/rstb.2014.0108 (2015)
Popovic, N. ; Marr, C. ; Swain, P.S.
J. Math. Biol. 72, 87-122 (2015)
Hug, S. ; Schwarzfischer, M. ; Hasenauer, J. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
Stat. Comp. 26, 663-677 (2015)
2014
Reversat, A. ; Buggenthin, F. ; Merrin, J. ; Leithner, A. ; de Vries, I. ; Theis, F.J. ; Marr, C. ; Sixt, M.
Mol. Biol. Cell 25:P537 (2014)
Khakhutskyy, V. ; Schwarzfischer, M. ; Hubig, N. ; Plant, C. ; Marr, C. ; Rieger, M.A. ; Schröder, T. ; Theis, F.J.
Lecture Notes Comp. Sci. 8649, 15-29 (2014)
2013
Buggenthin, F. ; Marr, C. ; Schwarzfischer, M. ; Hoppe, P.S. ; Hilsenbeck, O. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
BMC Bioinformatics 14:297 (2013)
2012
Sonnenschein, N. ; Marr, C. ; Hütt, M.-T.
Metabolites 2, 632-647 (2012)
Marr, C. ; Strasser, M. ; Schwarzfischer, M. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
FEBS J. 279, 3488-3500 (2012)
Konrad, M. ; Vyleta, M.L. ; Theis, F.J. ; Stock, M. ; Tragust, S. ; Klatt, M. ; Drescher, V. ; Marr, C. ; Ugelvig, L.V. ; Cremer, S.
PLoS Biol. 10:e1001300 (2012)
2011
Schwarzfischer, M. ; Marr, C. ; Krumsiek, J. ; Hoppe, P.S. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
In: Proceedings (Microscopic Image Analysis with Applications in Biology, 2nd September 2011, Heidelberg, Germany). Heidelberg: MIAAB, 2011. http://www.miaab.org/miaab-2011-
Kowarsch, A. ; Preusse, M. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
RNA 17, 809-819 (2011)
Krumsiek, J. ; Marr, C. ; Schroeder, T. ; Theis, F.J.
PLoS ONE 6:e22649 (2011)
2010
Wittmann, D.M. ; Marr, C. ; Theis, F.J.
J. Theor. Biol. 266, 436-448 (2010)
Kowarsch, A. ; Marr, C. ; Schmidl, D. ; Ruepp, A. ; Theis, F.J.
PLoS ONE 5:e11154 (2010)
Liebovitch, L.S. ; Shehadeh, L.A. ; Jirsa, V.K. ; Hütt, M.-T. ; Marr, C.
In: Das, S.* ; Caragea, D.* ; Welch, S.* ; Hsu, W.H.* [Eds.]: Handbook of Research on Computational Methodologies in Gene Regulatory Networks. IGI Global, 2010. 405-428
Lutter, D. ; Marr, C. ; Krumsiek, J. ; Lang, E.W. ; Theis, F.J.
BMC Genomics 11:224 (2010)
Marr, C. ; Theis, F.J. ; Liebovitch, L.S. ; Hütt, M.-T.
PLoS Comput. Biol. 6, 31:e1000836 (2010)
2009
Marr, C. ; Hütt, M.-T.
Phys. Lett. A 373, 546-549 (2009)
Webb, K.J. ; Norton, W.H.J. ; Trümbach, D. ; Meijer, A.H. ; Ninkovic, J. ; Topp, S. ; Heck, D. ; Marr, C. ; Wurst, W. ; Theis, F.J. ; Spaink, H.P. ; Bally-Cuif, L.
Genome Biol. 10:R81 (2009)
2008
Marr, C. ; Geertz, M. ; Hütt, M.-T. ; Muskhelisvili, G.
BMC Syst. Biol. 2:18 (2008)
2007
Marr, C. ; Müller-Linow, M. ; Hütt, M.-T.
Phys. Rev. E 75:041917 (2007)
2006
Marr, C. ; Hütt, M.-T.
Phys. Lett. A 349, 302-305 (2006)
2005
Marr, C. ; Hütt, M.-T.
Physica A 354, 641-662 (2005)
Beige, A. ; Cable, H. ; Marr, C. ; Knight, P.
Laser Phys. 15, 162-169 (2005)
2003
Marr, C. ; Beige, A. ; Rempe, G.
Phys. Rev. A 68:033817 (2003)

* external authors, # joint first authors, ° joint corresponding authors