Publications

The Institute of Functional Epigenetics was established in 2016. Publication lists for each of the research teams can be found in the Research section.

2021
Claude, K.-L. ; Bureik, D. ; Chatzitheodoridou, D. ; Adarska, P. ; Singh, A. ; Schmoller, K.M.
Nat. Commun. 12:4202 (2021)
Skalska, L. ; Begley, V. ; Beltran, M. ; Lukauskas, S. ; Khandelwal, G. ; Faull, P. ; Bhamra, A. ; Tavares, M. ; Wellman, R. ; Tvardovskiy, A. ; Foster, B. ; Ruiz de Los Mozos, I. ; Herrero, J. ; Surinova, S. ; Snijders, A.P. ; Bartke, T. ; Jenner, R.G.
Mol. Cell 81, 2944-2959.e10 (2021)
Lima, A. ; Lubatti, G. ; Burgstaller, J. ; Hu, D. ; Green, A.P. ; di Gregorio, A. ; Zawadzki, T. ; Pernaute, B. ; Mahammadov, E. ; Perez-Montero, S. ; Dore, M. ; Sanchez, J.M. ; Bowling, S. ; Sancho, M. ; Kolbe, T. ; Karimi, M.M. ; Carling, D. ; Jones, N. ; Srinivas, S. ; Scialdone, A. ; Rodriguez, T.A.
Nat. Metab., DOI: 10.1038/s42255-021-00422-7 (2021)
De Pastina, A. ; Padovani, F. ; Brunetti, G. ; Rotella, C. ; Niosi, F. ; Usov, V. ; Hegner, M.
Rev. Sci. Instruments 92:065001 (2021)
Nitsch, S. ; Zorro Shahidian, L. ; Schneider, R.
EMBO Rep. 22:e52774 (2021)
Iturbide Martinez De Albeniz, A. ; Ruiz Tejada Segura, M.L. ; Noll, C. ; Schorpp, K.K. ; Rothenaigner, I. ; Ruiz-Morales, E.R. ; Lubatti, G. ; Agami, A. ; Hadian, K. ; Scialdone, A. ; Torres-Padilla, M.E.
Nat. Struct. Mol. Biol. 28, 521-532 (2021)
Santos-Rosa, H. ; Millán-Zambrano, G. ; Han, N. ; Leonardi, T. ; Klimontova, M. ; Nasiscionyte, S. ; Pandolfini, L. ; Tzelepis, K. ; Bartke, T. ; Kouzarides, T.
Mol. Cell 81, 2793-2807.e8 (2021)
Belousov, K.I. ; Filatov, N.A. ; Kukhtevich, I. ; Kantsler, V. ; Evstrapov, A.A. ; Bukatin, A.S.
Sci. Rep. 11:8797 (2021)
Tyser, R.C.V. ; Ibarra-Soria, X. ; McDole, K. ; A Jayaram, S. ; Godwin, J. ; van den Brand, T.A.H. ; Miranda, A.M.A. ; Scialdone, A. ; Keller, P.J. ; Marioni, J.C. ; Srinivas, S.
Science 371:eabb2986 (2021)
Brunetti, G. ; Padovani, F. ; De Pastina, A. ; Rotella, C. ; Monahan, A. ; Hoffman, S.L. ; Jongo, S.A. ; Abdulla, S. ; Corradin, G. ; Pluschke, G. ; Daubenberger, C. ; Hegner, M.
Nanoscale 13, 2338-2349 (2021)
Zorro Shahidian, L. ; Haas, M. ; Le Gras, S. ; Nitsch, S. ; Mourao, A. ; Geerlof, A. ; Margueron, R. ; Michaelis, J. ; Daujat, S. ; Schneider, R.
EMBO Rep. 22:e51009 (2021)
Petryk, N. ; Bultmann, S. ; Bartke, T. ; Defossez, P.-A.
Nucleic Acids Res. 49, 3020–3032 (2021)
2020
Bheda, P. ; Aguilar-Gómez, D. ; Kukhtevich, I. ; Becker, J. ; Charvin, G. ; Kirmizis, A. ; Schneider, R.
STAR Protoc. 1:100228 (2020)
Fiorentino, J. ; Torres-Padilla, M.E. ; Scialdone, A.
Annu. Rev. Genet. 54, 167-187 (2020)
Ignatova, V.V. ; Kaiser, S. ; Ho, J.S.Y. ; Bing, X. ; Stolz, P. ; Tan, Y.X. ; Lee, C.L. ; Gay, F.P.H. ; Lastres, P.R. ; Gerlini, R. ; Rathkolb, B. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Sanz-Moreno, A. ; Klein-Rodewald, T. ; Calzada-Wack, J. ; Ibragimov, E. ; Valenta, M. ; Lukauskas, S. ; Pavesi, A. ; Marschall, S. ; Leuchtenberger, S. ; Fuchs, H. ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M. ; Bultmann, S. ; Rando, O.J. ; Guccione, E. ; Kellner, S.M. ; Schneider, R.
Sci. Adv. 6:eaaz4551 (2020)
Bheda, P. ; Kirmizis, A. ; Schneider, R.
Curr. Genet. 66, 1029–1035 (2020)
Strunz, M. ; Simon, L. ; Ansari, M. ; Kathiriya, J.J. ; Angelidis, I. ; Mayr, C. ; Tsidiridis, G. ; Lange, M. ; Mattner, L. ; Yee, M. ; Ogar, P. ; Sengupta, A. ; Kukhtevich, I. ; Schneider, R. ; Zhao, Z. ; Voss, C. ; Stöger, T. ; Neumann, J.H.L. ; Hilgendorff, A. ; Behr, J. ; O'Reilly, M. ; Lehmann, M. ; Burgstaller, G. ; Königshoff, M. ; Chapman, H.A. ; Theis, F.J. ; Schiller, H. B.
Nat. Commun. 11:3559 (2020)
Huang, S.S.Y. ; Makhlouf, M. ; AbouMoussa, E.H. ; Ruiz Tejada Segura, M.L. ; Mathew, L.S. ; Wang, K. ; Leung, M.C. ; Chaussabel, D. ; Logan, D.W. ; Scialdone, A. ; Garand, M. ; Saraiva, L.R.
Mol. Metab. 40:101038 (2020)
Kukhtevich, I. ; Lohrberg, N. ; Padovani, F. ; Schneider, R. ; Schmoller, K.M.
Nat. Commun. 11:2952 (2020)
Bheda, P. ; Aguilar-Gomez, D. ; Becker, N.B. ; Becker, J. ; Stavrou, E. ; Kukhtevich, I. ; Höfer, T. ; Maerkl, S. ; Charvin, G. ; Marr, C. ; Kirmizis, A. ; Schneider, R.
Mol. Cell 78, 915-925 (2020)
Bheda, P.
Mol. Metab. 38:100955 (2020)
Solovey, M. ; Scialdone, A.
Bioinformatics 36, 4296-4300 (2020)
Bartke, T. ; Schneider, R.
Mol. Metab. 38:100987 (2020)
Angerer, P. ; Fischer, D.S. ; Theis, F.J. ; Scialdone, A. ; Marr, C.
Bioinformatics 36, 4291-4295 (2020)
Ignatova, V.V. ; Stolz, P. ; Kaiser, S. ; Gustafsson, T.H. ; Lastres, P.R. ; Sanz-Moreno, A. ; Cho, Y.-L. ; Amarie, O.V. ; Aguilar-Pimentel, J.A. ; Klein-Rodewald, T. ; Calzada-Wack, J. ; Becker, L. ; Marschall, S. ; Kraiger, M.J. ; Garrett, L. ; Seisenberger, C. ; Hölter, S.M. ; Borland, K. ; Van De Logt, E. ; Jansen, P.W.T.C. ; Baltissen, M.P. ; Valenta, M. ; Vermeulen, M. ; Wurst, W. ; Gailus-Durner, V. ; Fuchs, H. ; Hrabě de Angelis, M. ; Rando, O.J. ; Kellner, S.M. ; Bultmann, S. ; Schneider, R.
Genes Dev. 34, 715-729 (2020)
2019
Beltran, M. ; Tavares, M. ; Justin, N. ; Khandelwal, G. ; Ambrose, J. ; Foster, B. ; Worlock, K.B. ; Kunzelmann, S. ; Herrero, J. ; Bartke, T. ; Gamblin, S.J. ; Wilson, J.R. ; Jenner, R.G.
Nat. Struct. Mol. Biol. 26, 899-909 (2019)
Mrozek-Gorska, P. ; Buschle, A. ; Pich, D. ; Schwarzmayr, T. ; Fechtner, R. ; Scialdone, A. ; Hammerschmidt, W.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 116, 16046-16055 (2019)
Ignatova, V.V. ; Jansen, P.W.T.C. ; Baltissen, M.P. ; Vermeulen, M. ; Schneider, R.
Sci. Rep. 9:6584 (2019)
Nakamura, K. ; Saredi, G. ; Becker, J.R. ; Foster, B. ; Nguyen, N.V. ; Beyer, T.E. ; Cesa, L.C. ; Faull, P.A. ; Lukauskas, S. ; Frimurer, T. ; Chapman, J.R. ; Bartke, T. ; Groth, A.
Nat. Cell Biol. 21, 311-318 (2019)
Campagne, A. ; Lee, M.K. ; Zielinski, D. ; Michaud, A. ; Le Corre, S. ; Dingli, F. ; Chen, H. ; Shahidian, L.Z. ; Vassilev, I. ; Servant, N. ; Loew, D. ; Pasmant, E. ; Postel-Vinay, S. ; Wassef, M. ; Margueron, R.
Nat. Commun. 10:348 (2019)
Brockers, K. ; Schneider, R.
Epigenomics 11, 363-366 (2019)
2018
Manoel, D. ; Makhlouf, M. ; Scialdone, A. ; Saraiva, L.R.
Chem. Senses 44, 7-9 (2018)
Foster, B. ; Stolz, P. ; Mulholland, C.B. ; Montoya, A. ; Kramer, H. ; Bultmann, S. ; Bartke, T.
Mol. Cell 72, 739-752 (2018)
Zorzan, E. ; Da Ros, S. ; Giantin, M. ; Zorro Shahidian, L. ; Guerra, G. ; Palumbo, M. ; Sissi, C. ; Dacasto, M.
J. Pharmacol. Exp. Ther. 367, 461-472 (2018)
Makowski, M.M. ; Grawe, C. ; Foster, B. ; Nguyen, N.V. ; Bartke, T. ; Vermeulen, M.
Nat. Commun. 9:1653 (2018)
Griffiths, J.A. ; Scialdone, A. ; Marioni, J.C.
Mol. Syst. Biol. 14:e8046 (2018)
Nieborak, A. ; Schneider, R.
Mol. Metab., DOI: 10.1016/j.molmet.2018.01.007 (2018)
Sarrach, S. ; Huang, Y. ; Niedermeyer, S. ; Hachmeister, M. ; Fischer, L. ; Gille, S. ; Pan, M. ; Mack, B. ; Kranz, G. ; Libl, D. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Paoluzzi Tomada, E. ; Kieslinger, M. ; Jeremias, I. ; Scialdone, A. ; Gires, O.
Sci. Rep. 8:1801 (2018)
2017
Schmoller, K.M.
Curr. Opin. Cell Biol. 49, 53-58 (2017)
Shahbazi, M.N. ; Scialdone, A. ; Skorupska, N. ; Weberling, A. ; Recher, G. ; Zhu, M. ; Jedrusik, A. ; Devito, L.G. ; Noli, L. ; Macaulay, I.C. ; Buecker, C. ; Khalaf, Y. ; Ilic, D. ; Voet, T. ; Marioni, J.C. ; Zernicka-Goetz, M.
Nature 552, 239-243 (2017)
Kebede, A.F. ; Nieborak, A. ; Shahidian, L.Z. ; Le Gras, S. ; Richter, F.M. ; Gomez, D.A. ; Baltissen, M.P. ; Meszaros, G. ; Magliarelli, H.F. ; Taudt, A. ; Margueron, R. ; Colomé-Tatché, M. ; Ricci, R. ; Daujat, S. ; Vermeulen, M. ; Mittler, G. ; Schneider, R.
Nat. Struct. Mol. Biol. 24, 1048–1056 (2017)
Izzo, A. ; Ziegler-Birling, C. ; Hill, P.W.S. ; Brondani, L. ; Hajkova, P. ; Torres-Padilla, M.E. ; Schneider, R.
J. Cell Biol. 216, 3017-3028 (2017)
Scahill, C.M. ; Digby, Z. ; Sealy, I.M. ; Wojciechowska, S. ; White, R.J. ; Collins, J.E. ; Stemple, D.L. ; Bartke, T. ; Mathers, M.E. ; Patton, E.E. ; Busch-Nentwich, E.M.
PLoS Genet. 13:e1006959 (2017)
Col, E. ; Hoghoughi, N. ; Dufour, S. ; Penin, J. ; Koskas, S. ; Faure, V. ; Ouzounova, M. ; Hernandez-Vargash, H. ; Reynoird, N. ; Daujat, S. ; Folco, E.J. ; Vigneron, M. ; Schneider, R. ; Verdel, A. ; Khochbin, S. ; Herceg, Z. ; Caron, C. ; Vourc'h, C.
Sci. Rep. 7:5418 (2017)
Chendeb, M. ; Schneider, R. ; Davidson, I. ; Fadloun, A.
Oncotarget 8, 38239-38250 (2017)
2016
Pradeepa, M.M. ; Grimes, G.R. ; Kumar, Y. ; Olley, G. ; Taylor, G.C.A. ; Schneider, R. ; Bickmore, W.A.
Nat. Genet. 48, 681-686 (2016)
Bheda, P. ; Jing, H. ; Wolberger, C. ; Lin, H.
Annu. Rev. Biochem. 85, 405-429 (2016)
Lawrence, M. ; Daujat, S. ; Schneider, R.
Trends Genet. 32, 42-56 (2016)
Izzo, A. ; Schneider, R.
Biochim. Biophys. Acta-Gene Regul. Mech. 1859, 486-495 (2016)
Kabra, D.G. ; Pfuhlmann, K. ; García-Cáceres, C. ; Schriever, S.C. ; Casquero García, V. ; Kebede, A.F. ; Fuente-Martin, E. ; Trivedi, C. ; Heppner, K. ; Uhlenhaut, N.H. ; Legutko, B. ; Kabra, U.D. ; Gao, Y. ; Yi, C.-X. ; Quarta, C. ; Clemmensen, C. ; Finan, B. ; Müller, T.D. ; Meyer, C.W. ; Paez-Pereda, M. ; Stemmer, K. ; Woods, S.C. ; Perez-Tilve, D. ; Schneider, R. ; Olson, E.N. ; Tschöp, M.H. ; Pfluger, P.T.
Nat. Commun. 7:10782 (2016)
Izzo, A. ; Schneider, R.
Genome Biol. 17:8 (2016)
Quarta, C. ; Schneider, R. ; Tschöp, M.H.
Cell 164, 341-342 (2016)