Barrier diseases

2018
Subramanian, V. ; Borchard, S. ; Azimzadeh, O. ; Sievert, W. ; Merl-Pham, J. ; Mancuso, M. ; Pasquali, E. ; Multhoff, G. ; Popper, B. ; Zischka, H. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
PPARα is necessary for radiation-induced activation of noncanonical TGFβ signaling in the heart.
J. Proteome Res. 17, 1677-1689 (2018)
Marozava, S. ; Vargas-López, R. ; Tian, Y. ; Merl-Pham, J. ; Braster, M. ; Meckenstock, R.U. ; Smidt, H. ; Röling, W.F.M. ; Westerhoff, H.V.
Metabolic flexibility of a prospective bioremediator: Desulfitobacterium hafniense Y51 challenged in chemostats.
Environ. Microbiol. 20, 2652-2669 (2018)
Frik, J. ; Merl-Pham, J. ; Plesnila, N. ; Mattugini, N. ; Kjell, J. ; Kraska, J. ; Gómez, R.M. ; Hauck, S.M. ; Sirko, S. ; Götz, M.
Cross-talk between monocyte invasion and astrocyte proliferation regulates scarring in brain injury.
EMBO Rep. 19:e45294 (2018)
Mattugini, N. ; Merl-Pham, J. ; Petrozziello, E. ; Schindler, L. ; Bernhagen, J. ; Hauck, S.M. ; Götz, M.
Influence of white matter injury on gray matter reactive gliosis upon stab wound in the adult murine cerebral cortex.
Glia, accepted (2018)
Sarrach, S. ; Huang, Y. ; Niedermeyer, S. ; Hachmeister, M. ; Fischer, L. ; Gille, S. ; Pan, M. ; Mack, B. ; Kranz, G. ; Libl, D. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Paoluzzi Tomada, E. ; Kieslinger, M. ; Jeremias, I. ; Scialdone, A. ; Gires, O.
Spatiotemporal patterning of EpCAM is important for murine embryonic endo-And mesodermal differentiation.
Sci. Rep. 8:1801 (2018)
2017
Philipp, J. ; Azimzadeh, O. ; Subramanian, V. ; Merl-Pham, J. ; Lowe, D. ; Hladik, D. ; Erbeldinger, N. ; Ktitareva, S. ; Fournier, C. ; Atkinson, M.J. ; Raj, K. ; Tapio, S.
Radiation-induced endothelial inflammation is transferred via the secretome to recipient cells in a STAT-mediated process.
J. Proteome Res. 16, 3903-3916 (2017)
Mutschelknaus, L. ; Azimzadeh, O. ; Heider, T. ; Winkler, K. ; Vetter, M. ; Kell, R. ; Tapio, S. ; Merl-Pham, J. ; Huber, S.M. ; Edalat, L. ; Radulović, V. ; Anastasov, N. ; Atkinson, M.J. ; Mörtl, S.
Radiation alters the cargo of exosomes released from squamous head and neck cancer cells to promote migration of recipient cells.
Sci. Rep. 7:12423 (2017)
Azimzadeh, O. ; Subramanian, V. ; Ständer, S. ; Merl-Pham, J. ; Lowe, D. ; Barjaktarovic, Z. ; Mörtl, S. ; Raj, K. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
Proteome analysis of irradiated endothelial cells reveals persistent alteration in protein degradation and the RhoGDI and NO signalling pathways.
Int. J. Radiat. Biol. 93, 920-928 (2017)
Mattugini, N. ; Ohlig, S. ; Merl-Pham, J. ; Kannaiyan, N. ; Hauck, S.M. ; Rossner, M.J. ; Götz, M.
Differences of grey and white matter astrocytes in the intact and injured cerebral cortex.
Glia 65, E404-E405 (2017)
Welk, V. ; Meul, T. ; Merl-Pham, J. ; Korfei, M. ; Koch, I. ; Semren, N. ; Guenther, A. ; Lindner, M. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.
Proteasomal activator 200 (pa200) regulates cellular proliferation: A putative role for Ipf and lung cancer pathogenesis.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 195 (2017)
Obermann, J. ; Priglinger, C.S. ; Merl-Pham, J. ; Geerlof, A. ; Priglinger, S.G. ; Götz, M. ; Hauck, S.M.
Proteome-wide identification of glycosylation-dependent interactors of Galectin-1 and Galectin-3 on mesenchymal retinal pigment epithelial cells.
Mol. Cell. Proteomics 16, 1528-1546 (2017)
Yentrapalli, R. ; Merl-Pham, J. ; Azimzadeh, O. ; Mutschelknaus, L. ; Peters, C. ; Hauck, S.M. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S. ; Mörtl, S.
Quantitative changes in the protein and miRNA cargo of plasma exosome-like vesicles after exposure to ionizing radiation.
Int. J. Radiat. Biol. 7, 1-12 (2017)
Mossina, A. ; Lukas, C. ; Merl-Pham, J. ; Uhl, F.E. ; Mutze, K. ; Schamberger, A.C. ; Staab-Weijnitz, C.A. ; Jia, J. ; Yildirim, A.Ö. ; Königshoff, M. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O. ; Meiners, S.
Cigarette smoke alters the secretome of lung epithelial cells.
Proteomics 17:1600243 (2017)
Subramanian, V. ; Seemann, I. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Stewart, F. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S. ; Azimzadeh, O.
The role of TGF beta and PPAR alpha signalling pathways in radiation response of locally exposed heart: Integrated global transcriptomics and proteomics analysis.
J. Proteome Res. 16, 307-318 (2017)
Barjaktarovic, Z. ; Merl-Pham, J. ; Azimzadeh, O. ; Kempf, S.J. ; Raj, K. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
Low-dose radiation differentially regulates protein acetylation and histone deacetylase expression in human coronary artery endothelial cells.
Int. J. Radiat. Biol. 93, 156-164 (2017)
Azimzadeh, O. ; Azizova, T.V. ; Merl-Pham, J. ; Subramanian, V. ; Bakshi, M.V. ; Moseeva, M. ; Zubkova, O. ; Hauck, S.M. ; Anastasov, N. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
A dose-dependent perturbation in cardiac energy metabolism is linked to radiation-induced ischemic heart disease in Mayak nuclear workers.
Oncotarget 8, 9067-9078 (2017)
2016
Deeg, C.A. ; Uhl, P.B. ; Amann, B. ; Blutke, A. ; Renner, S. ; Hirmer, S. ; Merl-Pham, J. ; Sekundo, W. ; Wanke, R. ; Wolf, E. ; Hauck, S.M.
The INSC94Y transgenic pig: A novel model for diabetic retinopathy with macular edema.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 57 (2016)
Yang, J. ; Bassuk, A.G. ; Merl-Pham, J. ; Hsu, C.W. ; Colgan, D.F. ; Li, X. ; Au, K.S. ; Zhang, L. ; Smemo, S. ; Justus, S. ; Nagahama, Y. ; Grossbach, A.J. ; Howard, M.A. ; Kawasaki, H. ; Feldstein, N.A. ; Dobyns, W.B. ; Northrup, H. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Mahajan, V.B. ; Tsang, S.H.
Catenin delta-1 (CTNND1) phosphorylation controls the mesenchymal to epithelial transition in astrocytic tumors.
Hum. Mol. Genet. 25, 4201-4210 (2016)
Bakshi, M.V. ; Azimzadeh, O. ; Merl-Pham, J. ; Verreet, T. ; Hauck, S.M. ; Benotmane, M.A. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
In-utero low-dose irradiation leads to persistent alterations in the mouse heart proteome.
PLoS ONE 11:e0156952 (2016)
Carella, P. ; Merl-Pham, J. ; Wilson, D.C. ; Dey, S. ; Hauck, S.M. ; Vlot, A.C. ; Cameron, R.K.
Comparative proteomics analysis of Arabidopsis phloem exudates collected during the induction of systemic acquired resistance.
Plant Physiol. 171, 1495-1510 (2016)
Ly, A. ; Merl-Pham, J. ; Priller, M. ; Gruhn, F. ; Senninger, N. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.
Proteomic profiling suggests central role of STAT signaling during retinal degeneration in the rd10 mouse model.
J. Proteome Res. 15, 1350-1359 (2016)
Cameron, R.K. ; Carella, P. ; Isaacs, M. ; Champigny, M. ; Merl-Pham, J. ; Dey, S. ; Vlot, A.C.
Using DIR1 to investigate long-distance signal movement during systemic acquired resistance.
Can. J. Plant Pathol. 38, 19-24 (2016)
Heinzelmann, K. ; Noskovicova, N. ; Merl-Pham, J. ; Preissler, G. ; Winter, H. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Hauck, S.M. ; Behr, J. ; Eickelberg, O.
Surface proteome analysis identifies platelet derived growth factor receptor-alpha as a critical mediator of transforming growth factor-beta-induced collagen secretion.
Int. J. Biochem. Cell Biol. 74, 44-59 (2016)
Vanzo, E. ; Merl-Pham, J. ; Velikova, V.B. ; Ghirardo, A. ; Lindermayr, C. ; Hauck, S.M. ; Bernhardt, J. ; Riedel, K. ; Durner, J. ; Schnitzler, J.-P.
Modulation of protein S-nitrosylation by isoprene emission in poplar.
Plant Physiol. 170, 1945-1961 (2016)
Priglinger, C.S. ; Obermann, J. ; Szober, C.M. ; Merl-Pham, J. ; Ohmayer, U. ; Behler, J. ; Gruhn, F. ; Kreutzer, T.C. ; Wertheimer, C. ; Geerlof, A. ; Priglinger, S.G. ; Hauck, S.M.
Epithelial-to-mesenchymal transition of RPE cells in vitro confers increased β1,6-N-glycosylation and increased susceptibility to galectin-3 binding.
PLoS ONE 11:e0146887 (2016)
Merl-Pham, J. ; Gruhn, F. ; Hauck, S.M.
Proteomic profiling of cigarette smoke induced changes in retinal pigment epithelium cells.
Adv. Exp. Med. Biol. 854, 785-791 (2016)
Grosche, A. ; Hauser, A. ; Lepper, M.F. ; Mayo, R. ; von Toerne, C. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M.
The proteome of native adult Muller glial cells from murine retina.
Mol. Cell. Proteomics 15, 462-480 (2016)
2015
Heinzelmann, K. ; Noskovicova, N. ; Merl-Pham, J. ; Lindner, M. ; Hatz, R.A. ; Behr, J. ; Hauck, S.M. ; Eickelberg, O.
TGF-beta affects nintedanib function via PDGFR alpha in primary human fibroblasts.
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 191:A2363 (2015)
Azimzadeh, O. ; Sievert, W. ; Sarioglu, H. ; Merl-Pham, J. ; Yentrapalli, R. ; Bakshi, M.V. ; Janik, D. ; Ueffing, M. ; Atkinson, M.J. ; Multhoff, G. ; Tapio, S.
Integrative proteomics and targeted transcriptomics analyses in cardiac endothelial cells unravel mechanisms of long-term radiation-induced vascular dysfunction.
J. Proteome Res. 14, 1203-1219 (2015)
Barjaktarovic, Z. ; Kempf, S.J. ; Sriharshan, A. ; Merl-Pham, J. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
Ionizing radiation induces immediate protein acetylation changes in human cardiac microvascular endothelial cells.
J. Radiat. Res. 56, 623-632 (2015)
Bi, Z. ; Merl-Pham, J. ; Uehlein, N. ; Zimmer, I. ; Mühlhans, S. ; Aichler, M. ; Walch, A.K. ; Kaldenhoff, R. ; Palme, K. ; Schnitzler, J.-P. ; Block, K.
RNAi-mediated downregulation of poplar Plasma membrane Intrinsic Proteins (PIPs) changes plasma membrane proteome composition and affects leaf physiology.
J. Proteomics 128, 321-332 (2015)
Skiöld, S. ; Azimzadeh, O. ; Merl-Pham, J. ; Näslund, I. ; Wersäll, P.J. ; Lidbrink, E.K. ; Tapio, S. ; Harms-Ringdahl, M. ; Haghdoost, S.
Unique proteomic signature for radiation sensitive patients: A comparative study between normo-sensitive and radiation sensitive breast cancer patients.
Mutat. Res. -Fund. Mol. Mech. Mutag. 776, 128-135 (2015)
Bakshi, M.V. ; Azimzadeh, O. ; Barjaktarovic, Z. ; Kempf, S.J. ; Merl-Pham, J. ; Hauck, S.M. ; Buratovic, S. ; Eriksson, P. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
Total body exposure to low-dose ionizing radiation induces long-term alterations to the liver proteome of neonatally exposed mice.
J. Proteome Res. 14, 366-373 (2015)
Molin, S. ; Merl, J. ; Dietrich, K.A. ; Regauer, M. ; Flaig, M. ; Letulé, V. ; Saucke, T. ; Herzinger, T. ; Ruzicka, T. ; Hauck, S.M.
The hand eczema proteome: Imbalance of epidermal barrier proteins.
Br. J. Dermatol. 172, 994-1001 (2015)
2014
Kölschbach, J. ; Mouttaki, H. ; Merl, J. ; Meckenstock, R.U.
Identification of naphthalene carboxylase subunits of the sulfate-reducing culture n47.
BioSpektrum Tagungband 2014, 69 (2014)
Vanzo, E. ; Ghirardo, A. ; Merl-Pham, J. ; Lindermayr, C. ; Heller, W. ; Hauck, S.M. ; Durner, J. ; Schnitzler, J.-P.
S-nitroso-proteome in poplar leaves in response to acute ozone stress.
PLoS ONE 9:e106886 (2014)
Heim, A. ; Grimm, C. ; Müller, U. ; Häußler, S. ; Mackeen, M.M. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Kessler, B.M. ; Schofield, C.J. ; Wolf, A. ; Böttger, A.
Jumonji domain containing protein 6 (Jmjd6) modulates splicing and specifically interacts with arginine-serine-rich (RS) domains of SR- and SR-like proteins.
Nucleic Acids Res. 42, 7833-7850 (2014)
Velikova, V.B. ; Ghirardo, A. ; Vanzo, E. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Schnitzler, J.-P.
Genetic manipulation of isoprene emissions in poplar plants remodels the chloroplast proteome.
J. Proteome Res. 13, 2005-2018 (2014)
Klar, R. ; Schober, S. ; Rami, M. ; Mall, S. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M. ; Admon, A. ; Slotta-Huspenina, J. ; Schwaiger, M. ; Stevanovic, S. ; Oostendorp, R.A. ; Busch, D.H. ; Peschel, C. ; Krackhardt, A.M.
Therapeutic targeting of naturally presented myeloperoxidase-derived HLA peptide ligands in myeloid leukemia cells by TCR-transgenic T cells.
Leukemia 28, 2355-2366 (2014)
Griciuc, A. ; Roux, M.J. ; Merl, J. ; Giangrande, A. ; Hauck, S.M. ; Aron, L. ; Ueffing, M.
Proteomic survey reveals altered energetic patterns and metabolic failure prior to retinal degeneration.
J. Neurosci. 34, 2797-2812 (2014)
2013
Degroote, R.L. ; Hauck, S.M. ; Treutlein, G. ; Amann, B. ; Fröhlich, K.J.H. ; Kremmer, E. ; Merl, J. ; Stangassinger, M. ; Ueffing, M. ; Deeg, C. A.
Expression changes and novel interaction partners of talin 1 in effector cells of autoimmune uveitis.
J. Proteome Res. 12, 5812–5819 (2013)
Mossina, A. ; Merl, J. ; Vosyka, O. ; Eickelberg, O. ; Hauck, S.M. ; Meiners, S.
Proteomic profiling of alveolar epithelial cells exposed to cigarette smoke extract.
Eur. Respir. J. 42 (2013)
Merl, J. ; Deeg, C.A. ; Swadzba, M.E. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.
Identification of autoantigens in body fluids by combining pull-downs and organic precipitations of intact immune complexes with quantitative label-free mass spectrometry.
J. Proteome Res. 12, 5656-5665 (2013)
Ly, A. ; Scheerer, M.F. ; Zukunft, S. ; Muschet, C. ; Merl, J. ; Adamski, J. ; Hrabě de Angelis, M. ; Neschen, S. ; Hauck, S.M. ; Ueffing, M.
Retinal proteome alterations in a mouse model of type 2 diabetes.
Diabetologia 57, 192-203 (2013)
Yentrapalli, R. ; Azimzadeh, O. ; Sriharshan, A. ; Malinowsky, K. ; Merl, J. ; Wojcik, A. ; Harms-Ringdahl, M. ; Atkinson, M.J. ; Becker, K.-F. ; Haghdoost, S. ; Tapio, S.
The PI3K/Akt/mTOR pathway is implicated in the premature senescence of primary human endothelial cells exposed to chronic radiation.
PLoS ONE 8:e70024 (2013)
Priglinger, C.S. ; Szober, C.M. ; Priglinger, S.G. ; Merl, J. ; Euler, K.N. ; Kernt, M. ; Gondi, G. ; Behler, J. ; Geerlof, A. ; Kampik, A. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M.
Galectin-3 induces clustering of CD147 and integrin-β1 transmembrane glycoprotein receptors on the RPE cell surface.
PLoS ONE 8:e70011 (2013)
Bakshi, M.V. ; Barjaktarovic, Z. ; Azimzadeh, O. ; Kempf, S.J. ; Merl, J. ; Hauck, S.M. ; Eriksson, P. ; Buratovic, S. ; Atkinson, M.J. ; Tapio, S.
Long-term effects of acute low-dose ionizing radiation on the neonatal mouse heart: A proteomic study.
Radiat. Environ. Biophys. 52, 451-461 (2013)
2012
Merl, J. ; Ueffing, M. ; Hauck, S.M. ; von Toerne, C.
Direct comparison of MS-based label-free and SILAC quantitative proteome profiling strategies in primary retinal Müller cells.
Proteomics 12, 1902-1911 (2012)

We use cookies to improve your experience on our Website. We need cookies to continuously improve the services, to enable certain features and when embedding services or content of third parties, such as video player. By using our website, you agree to the use of cookies. We use different types of cookies. You can personalize your cookie settings here:

Only cookies permitted that are required for the basic functionality of our websites.
Permit cookies that help us to analyse the page views and user behavior on our websites. We only use this information for improving our services.
Permit embedded content and cookies from third party providers. This setting enables the full use of our web services (e.g. displaying videos).
Please find more information in our privacy statement.

There you may also change your settings later.